应用关闭后，由闹钟管理器设置的闹钟会被清除。

以下是一个示例代码，演示了如何使用闹钟管理器设置闹钟，并在应用关闭后清除闹钟：

import android.app.AlarmManager;
import android.app.PendingIntent;
import android.content.Context;
import android.content.Intent;

public class AlarmUtils {

    public static void setAlarm(Context context, long triggerTimeMillis) {
        AlarmManager alarmManager = (AlarmManager) context.getSystemService(Context.ALARM_SERVICE);
        Intent intent = new Intent(context, AlarmReceiver.class);
        PendingIntent pendingIntent = PendingIntent.getBroadcast(context, 0, intent, PendingIntent.FLAG_UPDATE_CURRENT);
        alarmManager.setExact(AlarmManager.RTC_WAKEUP, triggerTimeMillis, pendingIntent);
    }

    public static void cancelAlarm(Context context) {
        AlarmManager alarmManager = (AlarmManager) context.getSystemService(Context.ALARM_SERVICE);
        Intent intent = new Intent(context, AlarmReceiver.class);
        PendingIntent pendingIntent = PendingIntent.getBroadcast(context, 0, intent, PendingIntent.FLAG_UPDATE_CURRENT);
        alarmManager.cancel(pendingIntent);
    }
}

在上面的示例中，我们定义了一个AlarmUtils类，其中有两个方法：setAlarm和cancelAlarm。

setAlarm方法用于设置闹钟，它接收一个Context对象和一个触发时间的毫秒数作为参数。在该方法中，我们首先获取闹钟管理器的实例，然后创建一个Intent对象，指定要触发的广播接收器AlarmReceiver。接下来，我们创建一个PendingIntent对象，将其与广播接收器的Intent对象关联起来。最后，我们使用闹钟管理器的setExact方法设置闹钟。

cancelAlarm方法用于取消闹钟，它也接收一个Context对象作为参数。在该方法中，我们首先获取闹钟管理器的实例，然后创建一个与广播接收器的Intent对象关联的PendingIntent对象。最后，我们使用闹钟管理器的cancel方法取消闹钟。

在你的应用中，你可以在适当的地方调用setAlarm方法来设置闹钟，在应用关闭时调用cancelAlarm方法来清除闹钟。