如何开发带有Bioconductor依赖的R包（之前的解决方案失败）？

1. 首先，需要确保在安装Bioconductor依赖包之前安装了Bioconductor。

2. 使用如下语句在DESCRIPTION文件中指定Bioconductor依赖：

Imports: Biobase (>= 2.15.0), GEOquery (>= 2.21.8)

3. 在NAMESPACE文件中添加指令以加载Bioconductor依赖：

import(Biobase)
importFrom(GEOquery, getGEO)

4. 在开发过程中，需要确保将Bioconductor依赖添加到NAMESPACE文件中，这可以通过执行如下语句来实现：

devtools::document()

5. 如果使用Travis CI在GitHub上构建软件包，则需要在.travis.yml文件中添加相应的Bioconductor安装命令，如下所示：

bioc_packages:
- Biobase
- GEOquery

完成上述步骤后，便可成功开发带有Bioconductor依赖的R包。

示例代码：

# 在安装Bioconductor依赖之前需安装Bioconductor
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()

# 在DESCRIPTION文件中指定Bioconductor依赖
Imports: Biobase (>= 2.15.0), GEOquery (>= 2.21.8)

# 在NAMESPACE文件中添加指令以加载Bioconductor依赖
import(Biobase)
importFrom(GEOquery, getGEO)

# 执行devtools::document()以将Bioconductor依赖添加到NAMESPACE文件中
devtools::document()

# 在.travis.yml文件中添加相应的Bioconductor安装命令
bioc_packages:
- Biobase
- GEOquery