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产品动态

最近更新时间2023.12.14 10:44:16

首次发布时间2022.10.30 09:50:22

2023.12.13
模块功能项子功能点具体功能项说明

Workspace

工作流

工作流运行支持挂载tos

【新增】支持工作流运行过程中无需从tos复制而是直接挂载tos桶,提升效率

工作流参数支持配置密钥【新增】支持在工作流参数中配置AKSK密钥,以支持tos挂载
NotebookNotebook运行配置【优化】选择镜像存档后展示镜像详情
Notebook运行【优化】独立Notebook启动kernel参数,减少启动时包冲突问题

CLI

Bioctl命令行工具

支持Bioctl进行Workspace相关命令

【新增】通过Bioctl Workspace相关command可以进行Workspace的创建、导入、导出、删除等

支持Bioctl进行Workflow相关命令【新增】通过Bioctl Workflow命令进行工作流导入,删除,罗列工作流投递历史
支持Bioctl进行投递相关命令【新增】通过Bioctl submission命令进行投递、终止投递、查询投递状态、查询运行输出
支持Bioctl进行Datamodel相关命令【新增】通过Bioctl datamodel命令进行数据模型导入,删除、罗列
2023.11.2
模块功能项子功能点具体功能项说明

Workspace

工作流

工作流输入参数类型扩展

【新增】工作流输入参数支持array int/float/boolean类型

Notebook支持Notebook保存镜像【新增】支持用户在Notebook运行中将当前环境保存为镜像
Notebook支持新的Notebook启动方式【新增】支Notebook选择镜像存档启动
数据文件上传下载优化【优化】支持文件批量下载和删除
2023.09.13
模块功能项子功能点具体功能项说明
公共公共新增个人+企业认证【新增】开通Bio-OS产品时需进行个人或企业认证

Workspace

workspace列表

workspace卡片

【优化】workspace卡片优化,更完整的标题和描述展示

workspace列表

workspace标签

【新增】支持为Workspace设置标签,可根据标签进行分类和筛选

workspace创建workspace默认关联共享集群【新增】创建workspace时默认关联共享集群,无需再手动关联集群

工作流

工作流导入

【新增】支持通过本地上传导入工作流

工作流导入【新增】支持通过TRS ID导入工作流
工作流投递【优化】支持重新投递时设置投递参数
Notebook运行设置【新增】支持Notebook挂载EBS存储盘进行扩容(超过20G存储后会额外收费)
数据集数据集列表数据集卡片【优化】数据集展示优化,增加列模式
数据集元数据数据集元数据规则【优化】优化数据集/文件相关的元数据规则
2023.08.14
模块功能项子功能点具体功能项说明
公共Workspace公共Workspace克隆克隆公共Workspace【优化】优化公共Workspace发布和克隆效率
概览概览页概览【优化】全面优化概览页,新增最近访问Workspace、资源中心、Bio-OS最佳实践、使用指南和常见问题,同时支持主账号查看当前所有工作流和Notebook总数以及所有Notebook实例并支持删除关联云盘
WorkspaceWorkspaceWorkspace【新增】创建Workspace时支持从公共Workspace克隆
NotebookNotebook运行【优化】Notebook以pip或者conda安装时默认使用国内源
NotebookNotebook运行配置【新增】Notebook运行配置新增计算规格和磁盘费用预估
NotebookNotebook运行配置【新增】Notebook提供免费20G磁盘用量
NotebookNotebook运行配置【新增】支持删除Notebook环境(配置及存储盘)
NotebookNotebook运行配置【新增】Notebook新增两个预设镜像Bioconductor和GATK
2023.07.11
模块功能项子功能点具体功能项说明
应用仓库数据集数据集展示【新增】新增数据集模块,展示公共数据集
数据集文件计算【新增】支持工作流输入参数关联数据集中的文件作为参考文件
WorkspaceWorkspace列表页Workspace排序【新增】默认按访问时间排序,支持按访问时间升降序排序
NotebookNotebook【新增】Notebook内使用pip安装默认使用国内源
SDKSDKSDK版本更新【新增】更新SDK,加入Notebook相关接口
2023.06.13
模块功能项子功能点具体功能项说明
应用仓库公共Workspace公共Workspace【新增】Bio-OS将提供公共Workspace,并支持从公共Workspace克隆到自己的Workspace中

Workspace

IAM

自定义策略

【新增】支持主账号为用户设定自定义策略分配权限

工作流

工作流运行

【优化】优化工作流运行过程中已完成的pod占用pod quota

工作流运行【优化】优化节点池扩容失败后的重试
工作流运行【优化】优化tos限流导致的下载速度为0且无法恢复
2023.5.19
模块功能项子功能点具体功能项说明

Workspace

工作流

工作流投递

【新增】任务运行新增GPU型号A10支持

任务资源监控【优化】Task运行完成后保留ResourceClamed
任务调度【优化】Pioneer调度套件优化
分析历史分析状态【优化】投递状态由“分析成功”和“分析失败”转为“分析完成”

Notebook

自定义镜像

【优化】报错提示信息优化

运行资源配置【优化】修改Notebook运行资源配置后,提示信息优化
存储挂载【新增】共享集群支持Notebook挂载tos
数据管理Workspace级别数据模型【优化】Workspace Data数据模型增加校验规则
SDK数据管理使用SDK上传数据模型【优化】CreateDataModel兼容List
2023.4.3
模块功能项子功能点具体功能项说明

Workspace

Workspace列表

Workspace支持离线分享

通过Workspace Schema实现Workspace的导入和导出功能,实现跨主账号的离线分享

工作流

查看资源监控

支持查看工作流运行中资源监控(共享集群)

实时日志支持查看运行中实时日志(共享集群)
分析历史新增停止操作支持终止投递或者工作流运行
分析历史投递新增重新投递支持对分析历史中的记录重新投递

分析历史新增总耗时

原有task列表中分析耗时修改为总耗时,新增分析耗时仅统计task具体执行时长

投递运行状态细化

投递状态新增"已终止"及“终止中”状态
工作流运行状态新增“启动中”、“终止中”、“已终止”
task状态新增“启动中”、“排队中”、“已终止”

WDL的图形化展示支持导入的WDL解析为DAG图
Notebook支持Notebook以自定义镜像启动支持选择自定义镜像启动Notebook实例
Notebook单元格支持插入复制图片通过复制粘贴一键在notebook中插入外部图片
2023.3.8
模块功能项子功能点具体功能项说明

Workspace

工作流

共享集群支持GPU运行

当工作流关联共享集群后,支持工作流调度到A30、T4两种GPU规格上

2023.2.10
模块功能项子功能点具体功能项说明
Workspace工作流工作流输入参数支持文件选择【新增】工作流输入参数支持文件选择
支持WDL中GPU参数【新增】支持WDL中GPU参数并调度到专属集群的VKE集群
NotebooksNotebook支持挂载对象存储【新增】Notebook关联专属集群为VKE集群时可挂载对象存储
Notebook支持文件列表展示【新增】支持Notebook直接读取文件列表数据
Notebook支持性能监控【新增】Notebook实例支持查看CPU和内存使用
集群管理共享集群创建共享集群【新增】支持创建共享集群
专属集群创建专属集群【新增】支持创建共享集群,移除原有纳管集群
专属集群密钥配置【新增】专属集群可配置密钥,用于获取用户的TOS对象存储桶
2022.12.12
模块功能项子功能点具体功能项说明
集群管理集群列表删除纳管集群【BUG修复】修复在解除纳管时,如当前集群不存在,无法解除纳管的问题

Workspace

工作流

导入工作流

【优化】导入工作流时支持从github导入

工作流运行

【优化】支持工作流私有镜像时call cache

【优化】支持以非数据模型开启工作流运行
【BUG修复】修复部分情况下无法拉取镜像的问题
分析历史分析历史详情查看【BUG修复】修复分析历史点击查看输入/输出参数页面空白

环境管理

关联集群

【BUG修复】修复未纳管集群时,关联集群页面空白的问题

2022年11月2日发布生信操作系统Bio-OS首个邀测版本
模块功能项子功能点具体功能项说明
集群管理纳管新集群纳管VKE集群选择当前账号下的VKE集群并进行纳管,纳管后可在Workspace中关联
集群列表删除纳管集群点击删除可将已纳管集群删除
刷新集群列表点击刷新按钮获取集群列表中集群状态
概览帮助文档点击跳转用户帮助文档
Workspaceworkspace列表列表操作新建、编辑、删除Workspace
Dashboard编辑Dashboard点击进入Notebook编辑页面
显示Workspace详情显示Workspace名称、描述、关联集群、集群类型、存储桶、Owner以及创建时间
数据文件列表页面上传文件、上传文件夹、创建文件夹、删除文件/文件夹
显示文件详情
复制文件http以及S3链接地址
实体数据模型下载CSV模版并导入CSV
下载、删除表格数据
支持生成数据集合
Workspace数据模型下载CSV模版并导入CSV
下载、删除表格数据
Notebooks新建Notebook新建、编辑、删除Notebook
复制Notebook复制notebook到任意Workspace
运行资源配置应用配置:选择启动镜像(三个预设镜像)
资源配置:选择Notebook启动资源(CPU、内存)
工作流导入工作流从git仓库中导入工作流
工作流列表更新、删除工作流,搜索、刷新工作流、按名称排序、按创建时间排序
详情工作流工作流描述文件、输入/输出参数展示
运行配置:输入样本数据选择、输入参数、输出参数
工作流支持按规则下拉列表进行配置
支持输入输出参数下载、上传json文件
运行分析工作流
分析历史分析历史列表查看分析历史详情、删除分析历史
分析历史详情查看查看数据实体对应的工作流运行状态
查看此次分析概览信息
查看每个工作流中task级别的运行状态
workflow configration支持工作流输入样本+配置复现
环境管理工作流关联集群关联工作流的运行集群
Notebook关联集群关联Notebook启动集群