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中位数与生存中位数(来自生存分析)

中位数是一个统计学中常用的概念,表示将一组数据按照大小排序后,位于中间位置的数值。而生存中位数是在生存分析中使用的概念,它表示在某个特定时间点上,有一半的个体仍然生存,而另一半已经发生了事件(比如死亡)。

下面是一个使用Python语言进行生存分析,并计算中位数与生存中位数的示例代码:

import pandas as pd
from lifelines import KaplanMeierFitter

# 创建一个包含时间和事件信息的DataFrame
data = pd.DataFrame({'time': [10, 12, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50],
                     'event': [1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 1]})

# 创建一个Kaplan-Meier估计器
kmf = KaplanMeierFitter()

# 根据数据拟合生存曲线
kmf.fit(data['time'], data['event'])

# 计算生存中位数
median_survival_time = kmf.median_survival_time_

# 打印生存中位数
print("生存中位数:", median_survival_time)

# 根据生存曲线描绘中位数点
import matplotlib.pyplot as plt

# 获取生存曲线数据
survival_prob = kmf.survival_function_
# 找到最接近生存中位数的时间点
closest_time = min(survival_prob[survival_prob >= 0.5].index)
# 获取最接近生存中位数的生存概率
closest_prob = survival_prob.loc[closest_time].values[0]

# 绘制生存曲线
kmf.plot()
# 绘制中位数点
plt.plot(closest_time, closest_prob, 'ro', label='Median')
plt.legend()
plt.xlabel('Time')
plt.ylabel('Survival Probability')
plt.title('Kaplan-Meier Survival Curve')
plt.show()

上述代码首先导入了pandas和lifelines库,分别用于处理数据和生存分析。然后,创建了一个包含时间和事件信息的DataFrame,其中时间表示观察时长,事件表示是否发生了事件(如死亡)。接着,创建了一个Kaplan-Meier估计器,并使用数据拟合了生存曲线。通过调用kmf.median_survival_time_可以计算得到生存中位数。最后,通过matplotlib库绘制了生存曲线,并在图中标注了中位数点。

注意:以上示例代码中的数据仅用于演示,实际应用中需要根据具体问题和数据进行适当调整。

本文内容通过AI工具匹配关键字智能整合而成,仅供参考,火山引擎不对内容的真实、准确或完整作任何形式的承诺。如有任何问题或意见,您可以通过联系service@volcengine.com进行反馈,火山引擎收到您的反馈后将及时答复和处理。
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