以连续方式提交Snakemake作业

要以连续方式提交Snakemake作业，可以使用以下步骤：

1. 创建一个Snakemake规则文件（通常命名为Snakefile），定义作业的工作流程和规则。以下是一个简单的示例：

rule all:
    input:
        "output.txt"

rule process_input:
    input:
        "input.txt"
    output:
        "output.txt"
    shell:
        "cat {input} > {output}"

2. 打开终端，并切换到Snakefile所在的目录。

3. 运行以下命令来启动Snakemake作业：

snakemake

这将开始执行Snakefile中的规则，并根据输入文件和输出文件的依赖关系自动决定要执行的规则。

如果你想使用其他参数来运行Snakemake作业，例如指定使用的CPU核心数量或使用集群资源，请将参数添加到上述命令中。例如：

snakemake --cores 4

这将使用4个CPU核心来运行作业。

注意：在运行Snakemake作业之前，请确保已安装Snakemake和所有所需的依赖项。

希望以上信息对你有所帮助！