网站中的JS脚本在成为Firefox插件时无法运行。

这个问题通常是因为Firefox安全机制的限制所导致的。解决方法是使用firefox的特殊对象browser来执行在网页上运行的脚本。以下是一些示例代码：

var { setTimeout } = Components.utils.import("resource://gre/modules/Timer.jsm", {});
setTimeout(function() {
  var appcontent = document.getElementById("appcontent");   // browser
  if(appcontent){

     //这里是网页上的JS脚本，例如alert("hello world");

     appcontent.addEventListener("DOMContentLoaded", function(event){
        //这里是网页加载完成后会运行的JS脚本
     }, false);
  }
}, 5000);

在这个示例中，我们使用browser对象来模拟网页的DOM，并在其中执行了JS脚本。其中通过addEventListener来监听DOMContentLoaded事件，可以确保JS脚本在网页加载完成后才被执行。