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生信分析用ubuntu什么版本

针对火山引擎公有云环境进行深度定制与优化的自研操作系统,提供了更安全高效的系统服务和环境

社区干货

集简云4月更新合集:新增25款集成应用,更新10款应用,新增近200个可用动作

鲜等六大行业,为客户提供一体化供应链解决方案和物流服务,帮助客户优化存货管理、减少运营成本、高效分配内部资源,实现新的增长。 官网:https://www.jdl.cn/ **可用执行动作*** 用... 用执行动作*** 保存订单* 保存抖音粉丝* 接收保存抖音粉丝私* 完成任务 **应用使用示例** **电商平台+鲸奇SCRM:** 当电商平台有新增订单时,鲸奇SCRM自动保存订单,用户后续商品售卖分析...

字节携多个议题登陆 GOTC 2023,更有特别展位邀你打卡

主要有以下几个方面的目的:+ 制定公司级开源战略:明确开源的价值、目标与策略,确保有体系、有目标地开展开源工作。+ 明确开源项目评审标准:筛选聚焦出高价值的重点项目,确保重点开源项目的资源支持与效果产出。... 如企业级云原微服务架构的中间件集合 **CloudWeGo** ,存储计算分离的数仓引擎 **ByConity** ,高性能 transformer 加速引擎 **lightseq** ,分布式深度学习通框架 **BytePS** ,云原生项目合集 **KubeWharf*...

弹性容器实例:从节点中心转型 Serverless 化架构的利器

Serverless 架构的成熟让云原技术进入全新阶段——Serverless 把公有云弹性伸缩、免运维、快速接入等特性发挥到了极致,极大降低了用户的使用成本,让用户和企业只需要专注于其业务逻辑,实现真正意义上的敏捷开发。... 主要表现在以下几个方面:* **节点运维复杂**:用户需要自行管理和维护节点,具体包括节点的配置与初始化、操作系统更新与升级、安全性管理、运行监控与日志采集分析、故障恢复、网络管理、存储管理、扩缩容、资源规...

火山引擎veStack荣获通院“可信云﹒专有云能力综合水平评估”认证

多云混合云等各类场景的用云需求,为用户提供全面、丰富的用云体验。与火山引擎公有云同源同构,veStack其内在技术栈历经了字节跳动抖音、今日头条等自有大型业务多年、大规模的应用实践的打磨和检验,在诞生之初即... 混合云等应用场景的首选云解决方案之一为目标。veStack整合了火山引擎丰富的业务增长、大数据、云原生、人工智能及多年积累的强大生态体系,致力于为包含金融、汽车、生信、泛互联网等领域用户提供全栈与公有云体验...

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生信分析用ubuntu什么版本-优选内容

Bio-OS简介
Bio-OS 生信操作系统是火山引擎面向生信从业者推出的全新的基于云原生化架构的生物医学信息分析平台,提供生物医学数据传输、数据存储、数据管理、生物信息分析等核心能力,端到端贯穿生信分析 Preprocessing-Processing-Postprocessing 全生命周期,Bio-OS 以 workspace 为工作核心,基于开放兼容的技术架构,帮助生物信息从业人员实现分析流程可重入、研究结果可复现、操作过程可追溯、知识可沉淀和传播的目标。平台支持全球基因组学...
云端生信分析时代和传统生信分析数据管理的差异
在传统的生物信息研究中,用户需要从公开的标准生信数据库中下载数据到本地进行存储,而在基于云端的生信分析平台中,数据永远存放在云端,以链接形式供用户随时随地访问、获取和使用,用户无需下载和存储,避免了传输过时间浪费、传输错误以及存储费用等现象。 传统的生物信息研究 每个用户均下载一份数据至本地存储,数据不共享 用户需要面临传输时间长、传输错误高、存储成本高的情况 因为数据在用户本地,用户做的研究对其他人而言...
Workspace理念
是实现科学研究和临床应用可执行,可移植,可复现,可分享,可发表的基本单位。 生信数据集管理:Bio-OS中的数据存储在云端,用户能够通过链接的形式进行直接使用,而不用下载到本地存储,从而节省传输时间成本和存储成本 生信数据模型:存储在云中不同位置的数据能够通过数据表格的形式有效的组织和展示,能够作为向量化计算的基础,同时也可将计算结果写回至数据表格 工作流:能够灵活、便捷的通过工作流开展基任意规模的基因分析任务 实...
火山引擎Bio-OS:帮助降低人力成本40%
随着第三代基因测序技术的引入,生物信息学的研究领域得以广泛拓展,为深度挖掘基因信息提供了更多的可能性,同时也带来了海量的数据分析和处理任务。 北京希望组生物科技有限公司(下文简称希望组)在打造全新的三代测序项目交付平台时,引用火山引擎 Bio-OS 解决方案,建立了基于 web 的生信数据分析平台,不仅有效降低生信数据分析门槛,也使售后人力成本降低了40%,运维成本降低了30%。 希望组(Grandomics)是全球知名的三代测序技术拓展...

生信分析用ubuntu什么版本-相关内容

应用场景

平台优势流程可移植: 基于云原生架构体系,并支持GA4GH规范标准,确保流程可移植,符合“一次构建,处处运行”的云原生理念。 结果可复现: 通过提供Dashboard、分析历史记录工作流配置等功能,确保生信研究的可复现性。 知识可分享: 通过以Workspace为核心开展生信分析工作,最终结果能够以workspace的形式进行沉淀、公开和传播。 应用场景Bio-OS生信分析平台端到端贯穿生信分析Preprocessing-Processing-Postprocessing全生命周期,...

Bio-OS中的工作流

工作流是由一系列步骤或者工具的集合组成 ,方便平台使用人员进行生信科研领域的自动化、批量化分析。Bio-OS面向开放兼容架构,遵循GA4GH的标准规范,能够兼容标准热门的生信分析工作流规范,目前支持WDL的语言规范,生信科研人员能够灵活便捷的开启任意规模的生信分析任务。 快速开启工作流分析您可以通过以下步骤快速开启一条或多条工作流的执行: 将您待测序或者待分析的样本制作为“数据模块”处的实体数据模型 从代码仓库中将您的...

火山引擎携手格物致和,打造大内存高速率智能化息云平台

精准医学快速发展的核心技术之一是科研及临床海量数据的产生,随着WGS 、WES、单细胞、空间转录组、空间蛋白组等新技术的普及,基因组和蛋白组的相关数据量快速增加,从而对于大数据分析计算、合理存储、数据安全等方面也提出了更高的要求。 云计算的兴起,解决了精准医学领域因数据骤增带来的计算效率降低,存储成本提升等痛点: 计算灵活弹性,以应对潮汐业务,面对高峰业务秒级启动,降低IT资产投入。同时引入异构计算,针对生信数据不...

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使用GATK进行基因组分析

GATK也越来越广泛地应用于其他物种的数据分析中。现在,GATK已经成为了基因组和RNA-seq分析过程中,寻找变异的行业标准。 第一部分:运行预配置的数据格式转换(Cram2Bam)您可以通过这部分了解数据的上传以及并成功运行工作流的方法。 该工作流程是一个文件格式转换,用于将基因组文件从一种格式 (CRAM) 转换为另一种格式 (BAM) 以进行下游分析。 登录生信操作系统Bio-OS并创建共享集群 登录生信操作系统控制台 在左侧导航栏单击 【...

如何在火山引擎中使用 NVIDIA Clara 平台--以 AutoDock 为例

背景AI技术已经成为医疗健康和生命科学领域发展的重要驱动力,以计算机视觉、自然语言处理、机器学习等为代表的人工智能技术已广泛渗透于医学影像、健康管理、生信分析、医疗信息化、药物研发、临床科研等多样化场景中。生物医学健康行业在应用AI技术时,往往存在一些难点,例如IT建设前期投入大、模型训练耗费大量算力、搭建和优化专用模型训练环境耗时较多等,这些都会影响企业的创新研究效率和业务开展。火山引擎机器学习平台与NV...

工作流

工作流(Workflow),是由多个连接步骤组成的一组指令,通常用于自动化的批量处理数据,可用于分析流程,Bio-OS的分析流程支持WDL描述语言,在工作流页面中,您可以选择本地导入、Git导入及TRS资源导入。导入后,即... 描述以及选择指定版本,最后点击导入。 比如在如下的dockstore的workflow中复制TRS ID![](https://portal.volccdn.com/obj/volcfe/cloud-universal-doc/upload_bb2eb3710e86a8cf5e9a5c04e303715d.png)配置工作...

共享集群

共享集群共享集群为用户提供了完全serveless化的基因计算服务,所有资源完全弹性按需,用户也只需为使用付费,更灵活、更经济、更便捷。创建共享集群并不会在云上实际购买或创建集群,而是在实际运行阶段才会按需创建及收费。 创建共享集群 点击【集群管理】-【创建共享集群】 点击输入共享集群名称及描述 共享集群名称:填写集群名称,名称规则如下 共享集群描述:填写共享集群描述,0-300字符,无字符限制 勾选协议及完成下单 在完...

火山引擎Bio-OS平台助力Sentieon,实现高效精准的基因组分析

随着物技术的不断进步,基因组分析在科研、医学诊断以及生物制药等多个领域中发挥着重要作用。这种分析方法对于深入理解生命本质、疾病成因以及药物研发等方面具有至关重要的意义。基因组分析的精准性和可靠性,为科学研究、医学诊断和生物制药等领域提供了强有力的技术支持,有助于推动相关领域的发展和进步。 Sentieon成立于2014年7月,专注于为生物息学应用开发高度优化的算法。其团队在图像处理、电信、计算光刻、大规模数据...

Notebook使用自定义镜像

生信操作系统Bio-OS支持您以自己的镜像作为Notebook的启动环境。这是一个分步指南,用于: 构建和发布自定义Docker镜像 使用修改后的Docker镜像在Bio-OS上运行Notebook 注意 在您使用Notebook自定义镜像功能前,以下三点请知悉 自定义镜像必须基于Bio-OS提供的基础镜像,否则可能会导致Notebook启动失败 自定义镜像会拉取您设置的镜像,这个过程中可能会产生流量费 过大的镜像可能会导致容器镜像启动超时,不建议您使用15G以上的镜...

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