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Bio-OS中的工作流

最近更新时间2022.11.06 10:06:39

首次发布时间2022.10.30 09:50:22

工作流是由一系列步骤或者工具的集合组成 ,方便平台使用人员进行生信科研领域的自动化、批量化分析。Bio-OS面向开放兼容架构,遵循GA4GH的标准规范,能够兼容标准热门的生信分析工作流规范,目前支持WDL的语言规范,生信科研人员能够灵活便捷的开启任意规模的生信分析任务。

快速开启工作流分析

您可以通过以下步骤快速开启一条或多条工作流的执行:

  1. 将您待测序或者待分析的样本制作为“数据模块”处的实体数据模型

  2. 从代码仓库中将您的工作流导入至平台上的“工作流”模块

  3. 点击引入对应的工作流,选择对应的实体数据模型表格中的数据:选择一行意味着有一个样本会进行分析,会产生1条工作流;选择多行意味着有多个样本会进行并行分析,会同时产生多条工作流

  4. 工作流配置:支持灵活便捷的工作流配置方式

    1. 手动输入

    2. 按this规则输入:this.索引对应的实体数据模型的属性列

    3. Json文件上传配置

  5. 点击投递,可以进入“分析历史”模块查看本次投递的运行记录