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火山引擎Bio-OS平台助力Sentieon,实现高效精准的基因组分析

最近更新时间2024.02.26 16:41:16

首次发布时间2024.02.26 16:41:16

随着生物技术的不断进步,基因组分析在科研、医学诊断以及生物制药等多个领域中发挥着重要作用。这种分析方法对于深入理解生命本质、疾病成因以及药物研发等方面具有至关重要的意义。基因组分析的精准性和可靠性,为科学研究、医学诊断和生物制药等领域提供了强有力的技术支持,有助于推动相关领域的发展和进步。

Sentieon成立于2014年7月,专注于为生物信息学应用开发高度优化的算法。其团队在图像处理、电信、计算光刻、大规模数据挖掘和生物信息学方面拥有丰富的经验。利用在应用建模、优化、机器学习和高性能计算方面的专业知识,Sentieon致力于为精准医疗提供精准数据。

内容来源于Sentieon官网


药物研发是一个复杂而严谨的过程,需要进行大量的试验和筛选,通过基因组数据分析能够在较短时间内获得更多的有效信息,减少试验次数和降低失败率。但是,在用户端管理和运行这些工作流程既复杂又耗时,同时还需要先行构建和维护昂贵的硬件设备,导致了价格的不确定性。行业内对降低测序和分析成本,以及提高检测精度的需求持续上升。

为了进一步提升基因组数据分析能力,Sentieon正积极探索有效路径,与火山引擎合作开发并验证了高效精准的基因组分析方案,确保数据处理的效率、准确度和可靠性,进而降低成本、加速洞察力的形成,提高研发成功率。


降低使用门槛,轻松完成检测


火山引擎Bio-OS平台是针对生物医药领域的一站式大数据解决方案,通过 Workspace 集成了数据、代码、工作流、镜像和环境,让用户仅需几次点击或调用一个 API,就能轻松运行预设的工作流程,简化了基因组数据分析的操作复杂度。为此,Sentieon尝试在Bio-OS上推出 DNAseq 和 DNAscope 流程,帮助研究人员和临床医生快速启动项目,更轻松、便捷、高效地分析基因组数据,完成变异检测。

Sentieon在火山引擎Bio-OS平台上推出以 Workspace 为核心的Sentieon分析流程,为客户提供了可预测的计算成本。客户在使用Sentieon产品时,仅需完成简单的准备工作即可顺利进行基因组数据分析,如获取Sentieon的有效 License 文件,确保已使用或注册了火山引擎公有云账号,并开通了Bio-OS生信操作系统及其依赖服务。这种便捷的操作方式,大大降低了客户的使用门槛,为基因组数据分析的普及和推广提供了有力支撑。

火山引擎一键式调用Sentieon工作流

降低研发成本,提高成功率


为验证方案的性能,Sentieon还选择公开的基因组数据集,通过火山引擎Bio-OS Workspace 执行Sentieon DNAscope 流程,以评估其在火山引擎上的运行效率、运行时间、资源消耗、成本和准确性。测试结果显示,与开源 GATK 流程相比,Sentieon DNAscope 流程在Bio-OS上处理测序数据展现出显著的速度优势,达到11.5倍加速,在准确率和效率上也均表现出优异的性能,这对于加速基因组数据分析、提高研发效率具有重要意义。

在火山引擎上Sentieon和GATK效率比对

Sentieon与火山引擎的合作开发,为生物医药领域的研究人员和临床医生提供了一个高效、便捷的基因组数据分析解决方案,有助于降低研发成本,提高研发成功率,推动医疗的发展。同时,火山引擎Bio-OS平台的出众表现也为Sentieon分析流程产品的高效运行提供了有力支撑。

未来,火山引擎将继续在生物医药领域深耕,帮助医药企业提高研发效率、降低生产成本、优化销售策略,从而更好地满足市场需求,提升企业的核心竞争力。同时,火山引擎还将积极与各类合作伙伴开展合作,共同推动生物医药行业的数字化转型。