程序启动时Cytoscape任务运行并将窗口缩小到无法阅读的尺寸。

要解决Cytoscape任务在启动时将窗口缩小到无法阅读的尺寸，可以使用以下代码示例来设置Cytoscape窗口的初始大小：

import org.cytoscape.application.CyApplicationManager;
import org.cytoscape.application.swing.CySwingApplication;

import javax.swing.JFrame;
import java.awt.Dimension;

public class CytoscapeWindowResize {
    public static void main(String[] args) {
        CySwingApplication cySwingApplication = null;
        CyApplicationManager cyApplicationManager = null;

        // 获取Cytoscape的Swing应用程序和应用程序管理器
        cySwingApplication = getService(CySwingApplication.class);
        cyApplicationManager = getService(CyApplicationManager.class);

        // 获取Cytoscape的主窗口
        JFrame cytoscapeWindow = cySwingApplication.getJFrame();

        // 设置初始窗口大小
        Dimension initialSize = new Dimension(800, 600);
        cytoscapeWindow.setPreferredSize(initialSize);
        cytoscapeWindow.setSize(initialSize);

        // 将窗口置于屏幕中央
        cytoscapeWindow.setLocationRelativeTo(null);

        // 显示Cytoscape窗口
        cytoscapeWindow.setVisible(true);
    }

    private static <T> T getService(Class<T> serviceClass) {
        // 从Cytoscape的应用程序管理器获取服务
        return cyApplicationManager.getService(serviceClass);
    }
}

在上述代码示例中，我们首先获取Cytoscape的Swing应用程序和应用程序管理器。然后，我们将主窗口的大小设置为初始大小（在示例中为800x600像素），并将其定位在屏幕中央。最后，我们使用setVisible(true)方法显示Cytoscape窗口。

请注意，上述代码示例是基于Cytoscape 3.x版本的Java API。具体的实现可能因Cytoscape版本的不同而有所差异。因此，在实际使用时，请根据您使用的Cytoscape版本和API文档进行适当的修改。