你遇到的ModuleNotFoundError: No module named 'sklearn'问题，本质上是Poetry虚拟环境的隔离特性导致的——默认情况下，Poetry创建的虚拟环境会完全独立于系统级的Python包，你通过apk add py3-scikit-learn安装的系统版sklearn，不在虚拟环境的包搜索路径里，所以脚本运行时找不到它。

结合你不能更换Linux发行版的要求，下面给你两种可行的解决办法：

方法一：让Poetry虚拟环境继承系统site-packages #

这是最直接的方案，通过配置让Poetry的虚拟环境自动包含系统级的site-packages目录，这样系统安装的sklearn就能被虚拟环境识别。

你可以修改Dockerfile，通过环境变量或者Poetry配置来开启这个功能：

修改后的Dockerfile示例

FROM python:3.13.2-alpine3.21
RUN apk --update add gcc build-base freetype-dev libpng-dev openblas-dev py3-scikit-learn
RUN pip install --upgrade pip
RUN pip install poetry==2.1.1

# 新增系统site-packages继承的配置
ENV POETRY_NO_INTERACTION=1 \
    POETRY_VIRTUALENVS_IN_PROJECT=1 \
    POETRY_VIRTUALENVS_CREATE=1 \
    POETRY_CACHE_DIR=/tmp/poetry_cache \
    POETRY_VIRTUALENVS_OPTIONS_SYSTEM_SITE_PACKAGES=true

WORKDIR /app

COPY pyproject.toml poetry.lock ./

RUN poetry install --without dev --no-root && rm -rf $POETRY_CACHE_DIR

COPY app ./app

WORKDIR ./app 

ENTRYPOINT ["poetry", "run", "python", "main.py"]

如果不想用环境变量，也可以在poetry install前添加一行配置命令：

RUN poetry config virtualenvs.options.system-site-packages true

方法二：手动软链接系统sklearn到Poetry虚拟环境 #

如果你不想让虚拟环境继承所有系统包（避免潜在的依赖冲突），可以只把sklearn及其依赖的系统包软链接到Poetry虚拟环境的site-packages目录中。

在Dockerfile的poetry install步骤之后，添加以下软链接命令：

# 软链接系统sklearn到虚拟环境site-packages（注意Python版本路径要和你的镜像一致）
RUN ln -s /usr/lib/python3.13/site-packages/sklearn /app/.venv/lib/python3.13/site-packages/sklearn
# 同步依赖包（Alpine的py3-scikit-learn依赖numpy、scipy等，也需要链接）
RUN ln -s /usr/lib/python3.13/site-packages/numpy /app/.venv/lib/python3.13/site-packages/numpy
RUN ln -s /usr/lib/python3.13/site-packages/scipy /app/.venv/lib/python3.13/site-packages/scipy

注意：请根据你使用的Python版本调整路径中的3.13部分（比如用Python3.12的话就改成3.12）。

关键注意事项 #

1. 确保你的pyproject.toml中不要包含scikit-learn的依赖项，否则Poetry会尝试自行安装，可能和系统包版本冲突。如果之前添加过，记得删除对应的配置行。
2. 验证方法：可以进入容器后执行poetry run python -c "import sklearn; print(sklearn.__version__)"，如果能正常输出版本号，说明配置成功。

备注：内容来源于stack exchange，提问作者ranemak