我之前也碰到过一模一样的问题！RStudio会悄悄帮你搞定CRAN镜像的配置，但CMD环境下跑R脚本时，默认不会加载RStudio保存的镜像设置——哪怕你在install.packages里加了参数，也可能因为参数格式或环境加载的问题失效。这里给你几个实用的解决办法：

• 在脚本开头先设置全局镜像选项
  直接在安装包代码前配置CRAN镜像的全局参数，确保脚本运行时能正确识别镜像地址：

  # 先设置国内CRAN镜像（速度更快，也可替换成你常用的镜像）
  options(repos = c(CRAN = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
  # 安装plyr包
  install.packages("plyr")
  

  不管是用Rscript运行脚本，还是在CMD里进入R交互模式执行，这样都能稳稳找到镜像。

• 给install.packages写全正确的repos参数
  如果你之前设置repos没生效，大概率是URL写错或者格式不对。试试把镜像地址完整写在参数里，同时尽量避免不必要的type参数干扰（Windows下默认二进制包安装更稳定）：

  install.packages("plyr", repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")
  

• 直接用CMD命令行完成安装（跳过脚本）
  如果脚本本身的环境加载有问题，可以绕开脚本，直接在CMD里用单条命令完成安装：

  R --slave -e "install.packages('plyr', repos='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/')"
  

说个题外话：为什么RStudio里没问题？因为RStudio第一次启动时会让你选CRAN镜像，并把这个配置存到你的用户R配置文件（比如.Rprofile）里，每次启动RStudio都会自动加载。但CMD里用Rscript跑脚本时，默认不会加载用户的.Rprofile（除非手动指定），所以必须在脚本里明确设置镜像才行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者anish shah