我之前也踩过旧版本R装包的坑，给你几个针对性的解决方案，按优先级试试：

1. 移除repos参数干扰，直接安装源码包 #

你原来的命令里加了repos="http://cran.us.r-project.org"，这会让R去检查当前CRAN对R 3.2.5的包兼容性，但旧版包在新CRAN的校验里可能被判不兼容。改成下面的命令试试：

install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/VIM/VIM_4.8.0.tar.gz", repos=NULL, type="source")

repos=NULL会告诉R直接使用你指定的源码包，跳过CRAN的兼容性检查。

2. 先安装匹配版本的依赖包 #

旧版VIM 4.8.0依赖其他R包的特定旧版本，比如colorspace、digest、mice等，如果你的电脑上这些依赖是最新版，会导致安装失败。你需要先从CRAN Archive下载对应旧版的依赖包，比如：

# 安装VIM 4.8.0依赖的旧版colorspace（版本号根据VIM的DESCRIPTION文件确定）
install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/colorspace/colorspace_1.2-6.tar.gz", repos=NULL, type="source")

你可以去VIM 4.8.0的DESCRIPTION文件里查具体依赖版本，或者直接从成功安装的那台电脑里导出依赖包的版本列表，照着安装。

3. 检查编译环境是否匹配 #

旧版本R（3.2.x）需要对应版本的编译工具：

• Windows用户：必须安装Rtools33（对应R 3.2.x的版本），并且确保Rtools的路径已经加到系统环境变量PATH里；
• macOS用户：需要安装Xcode的旧版本（比如Xcode 7.3），或者用Homebrew安装对应版本的gcc；
• Linux用户：安装系统依赖库的旧版本，比如libxml2-dev、libcurl4-openssl-dev，可以通过指定版本号安装（比如Ubuntu用apt-get install libxml2-dev=2.9.1+dfsg1-5ubuntu1）。
  另一台电脑能成功，很大概率是它的编译环境刚好匹配R 3.2.5。

4. 直接复制已安装的包目录 #

如果不想折腾编译，最简单的方法是从那台成功安装的电脑上复制VIM包的文件夹：

1. 在成功的电脑上找到R的library目录，比如Windows是C:\Program Files\R\R-3.2.5\library\VIM，Linux/macOS是~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/VIM；
2. 把整个VIM文件夹复制到你当前电脑的对应library目录下；
3. 重启R，运行library(VIM)测试是否能正常加载。

关于Bioconductor 3.2的适配 #

Bioconductor 3.2对应R 3.2.x，不要用新版的Bioc安装命令，直接从Bioconductor的Archive下载旧版包安装：

install.packages("https://bioconductor.org/packages/3.2/bioc/src/contrib/Archive/VIM/VIM_4.8.0.tar.gz", repos=NULL, type="source")

同样要确保依赖包也是Bioconductor 3.2版本的。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Keity