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Bio-OS数据都有可能存储在哪里

最近更新时间2023.02.18 21:47:09

首次发布时间2022.10.30 09:50:22

相较于传统的需要将数据拷贝至本地的数据使用方式,云端场景的使用方式可能会不直观。当在讨论Bio-OS平台中workspace内的数据时,除了您Workspace对应的存储桶中存放的数据外,以链接的形式将数据链接到您的Workspace中(实际上不存在在您的Workspace对应存储桶中)也是常见的。实际上,当分析数据时,除了需要上传样本数据外,其他的数据不会复制到您的Workspace存储桶中,相反所有分析都在云中完成,并且只有生成的数据可能会存储在工作区存储桶中。
通常,在Bio-OS中分析的数据将位于以下三个位置:

  • Workspace存储桶:一般情况您上传的个人数据(如样本数据)、工作流运行的输出数据以及Notebook中的ipynb文件会存储在Workspace存储桶中

  • Workspace外部的存储桶:您使用的大部分数据将存储在云中的其他一些数据存储中(如提供的公开参考基因组数据),只要您拥有正确的权限和授权,您就可以在Bio-OS中访问、获取和使用

  • 容器集群:在使用Notebook模块进行交互式分析时,生成的输出数据默认存储在容器集群的持久化存储PVC中。此外,如果您需要与他人共享这些数据,可以将这些数据复制至Workspace存储桶中