如何为ComplexUpset Upset图中所有集合外的元素设置颜色

你之前的尝试存在两个核心问题：代码语法不完整，且对upset_query的参数使用有误。以下是两种可行的解决方案：

方法一：通过intersection指定空交集 #

直接用character(0)表示空交集（即不属于A、B、C任何集合的元素），搭配完整语法调用：

library(ComplexUpset)

abc_data = create_upset_abc_example()

upset(abc_data,
      intersect = c('A', 'B', 'C'),
      upset_query(
        intersection = character(0),  # 代表不属于任何指定集合的元素
        fill = 'red'
      )
)

方法二：通过filter筛选目标行 #

直接写出筛选条件，匹配A、B、C均为FALSE的行：

library(ComplexUpset)

abc_data = create_upset_abc_example()

upset(abc_data,
      intersect = c('A', 'B', 'C'),
      upset_query(
        filter = !A & !B & !C,
        fill = 'red'
      )
)

之前写法无效的原因 #

1. 语法错误：你提供的三段代码都缺少upset_query的闭合括号)，导致代码无法正常执行。
2. 参数使用错误：set = ''或intersection = c("")是无效写法——空字符串不是合法的集合名称，空交集需要用character(0)表示，或者直接通过筛选条件定位目标行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Bright381