如何从命令行运行nf-core非主分支工作流?
如何运行nf-core工作流的特定分支?
要指定nf-core工作流的特定分支运行,需使用NextFlow的-r(或完整写法-revision)参数,而非无效的--branch或-branch选项,具体命令示例如下:
nextflow run nf-core/seqinspector -r dev
补充说明:
-r参数支持指定分支名、标签名或具体的Git提交哈希值,NextFlow会自动拉取对应版本的工作流代码- 若已本地克隆目标nf-core工作流仓库,也可先切换到对应分支,再通过
-path参数指定本地路径运行,但直接使用-r拉取远程分支是更便捷的方式
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Christopher Bottoms
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