Ubuntu 18.04下R 4.4.2安装包时编译器找不到charconv头文件

错误原因 #

• charconv是C17标准库的头文件，但Ubuntu 18.04默认的gcc/g 7.5.0对C++17的支持不完全，缺失该头文件。
• R 4.4.2默认启用C++17编译依赖包，导致curl包编译时触发此错误。

解决方案 #

方法一：升级编译器到gcc 8及以上

• 添加Ubuntu Toolchain PPA以获取更高版本编译器：

sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test
sudo apt update

• 安装gcc-8和g++-8：

sudo apt install gcc-8 g++-8

• 设置gcc-8和g++-8为默认编译器：

sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-8 80 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-8

• 验证版本切换结果：

gcc --version
g++ --version

确认输出显示gcc版本为8.x.x后，重新在R中安装所需包。

方法二：强制R使用C++14编译

如果不想升级编译器，可修改R的编译标准：

• 临时生效（仅当前R会话）：
  在RStudio中执行：

Sys.setenv(CXX17 = "g++ -std=c++14")
install.packages("curl")
install.packages(c("sesame", "minfi"))

• 永久生效（所有R会话）：
  创建或编辑~/.R/Makevars文件：

mkdir -p ~/.R
echo 'CXX17 = g++ -std=c++14' >> ~/.R/Makevars

重启RStudio后再安装包即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者StlCh