升级targets至1.11.3后tar_make()重复执行报错而非跳过流水线

脚本代码 #

library(targets)
list(
  tar_target(states0_1, c("U")),
  tar_target(res1_1, identity(states0_1))
)

首次执行情况 #

首次执行tar_make(res1_1)运行正常，输出如下：

> tar_make(res1_1)
+ states0_1 dispatched                       
✔ states0_1 completed [0ms, 53 B]
+ res1_1 dispatched
✔ res1_1 completed [0ms, 53 B]
✔ ended pipeline [258ms, 2 completed, 0 skipped]
Warning message:
package ‘targets’ was built under R version 4.3.3 

二次执行错误 #

再次执行tar_make(res1_1)时，并未跳过已构建的流水线，反而抛出错误：

> tar_make(res1_1)
Warning message:                    
package ‘targets’ was built under R version 4.3.3 
Error:
! Error in tar_make():
  Item 7 of list input is not an atomic vector
  See https://books.ropensci.org/targets/debugging.html

已尝试操作 #

• 卸载并重装targets包
• 执行tar_destroy()后可重新运行流水线，但再次执行仍会出现相同错误

解决方案 #

这个问题核心是targets的元数据缓存出现异常，结合你看到的R版本与包编译版本不匹配的警告，可按以下步骤解决：

• 彻底清理缓存：除了tar_destroy()，手动删除项目根目录下的.targets文件夹，完全清空旧的元数据和缓存文件，再重新运行流水线。
• 匹配R与包版本：如果你的R版本不是4.3.3，用install.packages("targets", type = "binary")安装适配当前R版本的预编译包，避免版本不兼容导致的元数据解析问题。
• 避免指定单个target执行：直接运行tar_make()让targets自动判断依赖状态，而非指定单个target，可规避元数据读取的异常。
• 更新到最新版targets：旧版本可能存在元数据处理的bug，执行install.packages("targets")更新到最新稳定版，通常能解决这类缓存相关问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sumali Bajaj