如何在ggplot对象下方添加显著性水平图例,以及在ggforestplot森林图中实现该需求的方法咨询
如何在ggplot对象下方添加显著性水平图例,以及在ggforestplot森林图中实现该需求的方法咨询
我正在用ggforestplot()绘制多个回归模型的结果,其中部分数据是用mice()插补得到的。为了最小可复现示例(MWE),我将使用ggforestplot包自带的示例数据:
# Load packages library(ggforestplot) library(tidyverse)
# Use the example data of the ggforestplot() package (only a few rows of it) df <- ggforestplot::df_linear_associations %>% filter(trait == "BMI") %>% slice(26:29)
在实际工作中,我先是对(部分插补后)数据的所有结果分别运行summary(pool(modelFit)),再把多个模型的结果汇总到一个数据框中。我的真实数据框结构和上述示例代码生成的结构完全一致。
示例数据展示:
# Display the example data df
#> # A tibble: 4 × 5
#> name trait beta se pvalue
#>
#> 1 Omega-3 % BMI -0.0187 0.00906 3.90e- 2
#> 2 DHA % BMI 0.0232 0.00913 1.11e- 2
#> 3 Unsaturation BMI -0.120 0.00906 3.21e-40
#> 4 Sphingomyelins BMI 0.0608 0.00938 9.10e-11
用ggforestplot()绘制森林图非常简单:
# Create plot ggforestplot::forestplot( df = df, name = name, estimate = beta, se = se, pvalue = pvalue, psignif = 0.002 )
问题:我该如何在这个图的下方添加一个图例,解释图中点标记所代表的显著性水平?可以参考另一个包ggstats的ggcoef_model()函数生成的图的效果:
# Load packages library(ggstats) # Load example data data(tips, package = "reshape") # Run linear model linear_model <- lm(tip ~ size + total_bill, data = tips) # Plot model ggcoef_model(linear_model)
Created on 2023-09-10 with reprex v2.0.2
备注:内容来源于stack exchange,提问作者vlangen
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