GitHub CLI执行gh repo clone时出现Permission denied (publickey)错误求助

我可以通过git clone https://github.com/rtyley/small-test-repo.git正常克隆仓库，但执行gh repo clone rtyley/small-test-repo时出现SSH权限拒绝错误：

Cloning into 'small-test-repo'...
git@github.com: Permission denied (publickey).
fatal: Could not read from remote repository.

Please make sure you have the correct access rights
and the repository exists.
failed to run git: exit status 128

执行gh auth status显示已正常登录，Git操作协议为SSH，令牌权限完整：

✓ Logged in to github.com account <my-github-account> (keyring)
  - Active account: true
  - Git operations protocol: ssh
  - Token: ghp_************************************
  - Token scopes: 'admin:enterprise', 'admin:gpg_key', 'admin:org', 'admin:org_hook', 'admin:public_key', 'admin:repo_hook', 'admin:ssh_signing_key', 'audit_log', 'codespace', 'copilot', 'delete:packages', 'delete_repo', 'gist', 'notifications', 'project', 'repo', 'user', 'workflow', 'write:discussion', 'write:network_configurations', 'write:packages'

手动指定SSH密钥执行ssh -T git@github.com -i <github-pubkey-file>能成功验证身份，但多次执行gh auth logout再gh auth login仍无法解决问题，怀疑和多SSH身份文件有关。

1. 配置SSH强制使用指定密钥 #

编辑~/.ssh/config（Windows用户路径为C:\Users\<你的用户名>\.ssh\config），添加GitHub专属配置，强制使用对应密钥：

Host github.com
  HostName github.com
  User git
  IdentityFile ~/.ssh/<你的GitHub私钥文件名>
  IdentitiesOnly yes

IdentitiesOnly yes会阻止SSH自动尝试其他身份文件，避免多密钥冲突。

2. 临时切换gh的克隆协议为HTTPS #

如果SSH问题暂时无法排查，可直接修改gh的Git操作协议为HTTPS，和你之前正常使用的克隆方式一致：

gh config set git_protocol https

之后再执行gh repo clone rtyley/small-test-repo即可正常克隆。

3. 校验gh关联的SSH密钥 #

查看gh当前绑定的SSH公钥指纹：

gh ssh-key list

对比该指纹与本地公钥文件的指纹（执行ssh-keygen -l -f ~/.ssh/<你的GitHub公钥文件名>.pub查看），确保两者一致。若不一致，重新添加正确的公钥到GitHub：

gh ssh-key add ~/.ssh/<你的GitHub公钥文件名>.pub --title "自定义标识标题"

4. 清除SSH代理缓存 #

若SSH代理缓存了旧身份，执行以下命令重置：

ssh-add -D
ssh-add ~/.ssh/<你的GitHub私钥文件名>

完成后再次尝试gh repo clone命令。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者silly-little-guy