R包更新提示“部分二进制包无源码”的含义及解决方法

警告含义 #

这个提示说明你使用的CRAN镜像中，部分Windows二进制包（预编译好可直接安装的包版本）没有对应的源码包。R在执行更新检查时，会同时校验二进制包和源码包的存在性与版本，当发现二进制包存在但匹配的源码包缺失时，就会抛出这条警告。

解决方法 #

• 直接忽略（推荐多数场景）：如果你的包更新已正常完成，这个警告仅为告知信息，不会影响包的正常使用。Windows用户日常使用只需要二进制包，源码包主要面向包开发者或需要自行编译的场景。
• 切换CRAN镜像：部分镜像可能同步不及时导致源码包缺失，可更换同步更完整的镜像，比如官方主镜像：

  update.packages(ask=FALSE, lib.loc=paths[1], repos='https://cloud.r-project.org/')
  

• 限定只检查二进制包：通过type="binary"参数让R跳过源码包检查，仅处理二进制包更新，彻底避免该警告：

  update.packages(ask=FALSE, lib.loc=paths[1], repos='https://cran.mirror.garr.it/CRAN/', type="binary")
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者robertspierre