如何清理混乱的本地与远程Git仓库并保留代码修改？

第一步：暂存当前所有未提交修改 #

先把本地所有暂存、未暂存、未跟踪的文件临时保存，确保修改不丢失：

git stash push -m "temp_save_all_changes"

执行后可用 git stash list 确认保存记录。

第二步：彻底清理提交历史中的大体积.exe文件 #

使用git filter-repo（Git 2.22+ 官方推荐工具，替代老旧的filter-branch）重写历史，彻底移除目标.exe文件的所有痕迹：

git filter-repo --path 你的大文件名称.exe --invert-paths

替换你的大文件名称.exe为实际文件名，执行后仓库历史会被完全清理。

第三步：强制推送清理后的历史到远程 #

由于提交历史已被修改，需要强制覆盖远程对应分支：

git push origin Improve_percentile_separation --force-with-lease

--force-with-lease比单纯--force更安全，能避免意外覆盖他人未同步的修改。

第四步：恢复本地修改 #

将之前暂存的所有修改恢复到工作区：

git stash pop

若恢复时出现冲突，手动解决冲突后提交即可。

后续预防 #

在仓库根目录创建.gitignore文件，添加规则避免后续误提交可执行文件：

echo "*.exe" >> .gitignore
git add .gitignore
git commit -m "Add .gitignore to exclude exe files"
git push origin Improve_percentile_separation

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Rainer Bärs