ggalluvial中轴矩形顺序调整问题：因子层级设置无效

针对你遇到的axis3和axis4分类顺序不生效的问题，按以下步骤调整：

1. 同时设置两个轴的因子水平 #

你仅配置了axis3的因子层级，但axis4也需要手动指定因子顺序才能符合预期：

# 设定axis3的分类顺序
df$axis3_score <- factor(df$axis3_score, levels = c("0", "2", "3"))
# 设定axis4的分类顺序
df$axis4_score <- factor(df$axis4_score, levels = c("low", "int", "high"))

2. 强制图层遵循因子排序规则 #

ggalluvial默认会根据数据频数或原始出现顺序重排分类，需在geom_stratum和geom_text中添加sort = FALSE参数，让图层严格遵循你定义的因子层级：

ggplot(df,
       aes(axis1 = axis1_score, 
           axis2 = axis2_score, 
           axis3 = axis3_score,
           axis4 = axis4_score,
           y = total_score)) +
  
  geom_flow(aes(fill = int_score, order = as.numeric(int_score)), width = 0.2) +
  
  # 添加sort = FALSE强制遵循因子顺序
  geom_stratum(width = 0.2, fill = "grey", sort = FALSE) +
  
  # 文本层同步设置sort = FALSE
  geom_text(stat = "stratum", aes(label = after_stat(stratum)), sort = FALSE) +
  
  scale_x_discrete(limits = c("axis1", "axis2", "axis3", "axis4"), expand = c(.1, .1)) +
  
  theme_minimal()

3. 额外排查方向 #

若上述调整后仍未解决问题，可尝试：

• 暂时注释geom_flow的order参数，确认是否该参数导致排序冲突
• 按因子顺序重新排列数据集：

df <- df %>% arrange(axis3_score, axis4_score)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Theo