Fedora 28下R报错找不到libgfortran.so.4的解决求助

我遇到过不少类似的库版本兼容问题，在Fedora这种滚动更新的发行版里很常见，给你几个可行的解决思路，不用等开发者更新也能搞定：

1. 安装GCC 7对应的兼容libgfortran包 #

Fedora的软件仓库通常会提供旧版本库的兼容包，你可以尝试直接安装GCC 7版本的libgfortran：

sudo dnf install libgfortran7

这个包会把libgfortran.so.4安装到系统路径里，R就能自动找到它。如果仓库里没有这个包，你可以搜索Fedora 28对应的libgfortran7 RPM包，下载后用rpm -ivh命令安装。

2. 手动指定库加载路径 #

如果你已经获取到libgfortran.so.4文件（比如从其他同版本系统复制、或自行编译得到），可以通过设置环境变量让R优先加载这个库：

• 临时生效：在终端先执行以下命令，再启动R：

  export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/your/libgfortran.so.4/directory:$LD_LIBRARY_PATH
  R
  

• 永久生效：把上面的export命令添加到你的~/.bashrc或~/.profile文件中，每次打开终端都会自动加载。也可以用系统级配置：在/etc/ld.so.conf.d/目录下新建r-libgfortran.conf文件，写入libgfortran.so.4所在的目录路径，然后执行：

  sudo ldconfig
  

3. 使用容器隔离环境 #

如果不想折腾系统库的版本冲突，可以用Docker创建一个包含GCC 7和R的隔离环境，完全不影响主机系统：
比如使用rocker的R镜像（选择依赖GCC7的版本），执行：

docker run -it rocker/r-ver:3.6 /bin/bash

在容器里你可以正常安装和使用那些依赖旧版本libgfortran的R包，还能把主机的R项目目录挂载到容器里方便操作。

4. 手动重新编译依赖包 #

对于报错的R包，你可以下载源码手动编译，通过指定兼容参数让它们适配系统的高版本GCC：

1. 从CRAN下载目标R包的源码tar.gz文件
2. 在终端执行编译命令，指定gfortran版本或兼容选项：

   # 如果系统安装了gfortran-7
   R CMD INSTALL --configure-args="--with-gfortran=/usr/bin/gfortran-7" your-package.tar.gz
   # 或者添加兼容编译选项，让高版本GCC兼容旧代码
   FFLAGS="-fallow-argument-mismatch" R CMD INSTALL your-package.tar.gz
   

这个方法需要你对编译参数有一定了解，但能从根本上解决包与系统库的兼容问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user3827165