如何在运行c.Rmd时自动执行外部a.Rmd与b.Rmd文件？

当然可以搞定！在R Markdown里，你完全不用每次手动跑a.Rmd和b.Rmd，只要在c.Rmd里加几行代码就能自动触发前置文件的执行。这里有两种实用的实现方式：

方法一：直接用rmarkdown::render()函数 #

这是最直接的方案，R Markdown自带的render()函数就是用来渲染.Rmd文件的。你只需要在c.Rmd的开头代码块里加入以下内容：

# 先执行a.Rmd
rmarkdown::render("a.Rmd")

# 再执行b.Rmd
rmarkdown::render("b.Rmd")

几个实用细节： #

• 如果a.Rmd/b.Rmd不在当前工作目录，记得写相对路径或者绝对路径，比如文件在scripts子文件夹里，就写成rmarkdown::render("scripts/a.Rmd")
• 要是想指定输出文件的位置和格式，可以加output_file参数，比如把a.Rmd的输出放到outputs文件夹里：

  rmarkdown::render("a.Rmd", output_file = "../outputs/a_result.html")
  

• 如果你的前置.Rmd需要传入参数（比如指定数据路径、年份），可以用params参数传递：

  rmarkdown::render("a.Rmd", params = list(data_path = "data/raw_data.csv", report_year = 2024))
  

方法二：封装成自定义execute()函数（更贴合你的需求） #

如果你希望代码像你示例里那样简洁，可以自己封装一个execute()函数，用法完全符合你的预期：

# 定义自定义执行函数
execute <- function(rmd_file) {
  rmarkdown::render(rmd_file)
}

# 调用函数执行前置文件
execute("a.Rmd")
execute("b.Rmd")

这样写出来的代码就和你想要的execute(a.Rmd)格式一模一样，看起来更清爽。

额外小提示 #

• 如果你不想让前置.Rmd的输出文件乱放在当前目录，可以用output_dir参数指定单独的输出文件夹，比如rmarkdown::render("a.Rmd", output_dir = "outputs")
• 要是前置.Rmd运行时会生成中间数据（比如处理好的数据集），一定要确保这些数据的保存路径能被c.Rmd正确读取，避免出现找不到文件的错误。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Chris