嘿，我之前也碰到过一模一样的问题，当时差点把输入法卸了重装，后来摸索出几个可行的解决办法，你可以挨个试试：

• 检查输入法标点跟随设置
  打开IBus的配置界面，找到智能拼音的专属设置项，看看有没有类似「标点跟随输入候选词」或者「即时标点匹配」的选项，把它勾选上。我当时就是没开这个选项，导致标点总跑到字词前面去。

• 临时调整输入习惯（应急用）
  要是一时找不到设置入口，输入完字词后先按空格确认候选词，再敲标点——虽然有点麻烦，但能立刻避免这个错乱问题，适合着急用的时候过渡。

• 更新输入法到最新版本
  这个问题大概率是旧版本的bug，我当时更新了IBus和智能拼音包之后，情况就好了很多。如果你用的是Debian/Ubuntu这类系统，可以在终端输这行命令更新：

  sudo apt update && sudo apt install --only-upgrade ibus ibus-pinyin
  

  其他系统的话，用对应的包管理器更新就行。

• 重置输入法配置
  有时候配置文件乱了也会出奇怪的问题，你可以先备份一下~/.config/ibus/下面的拼音配置文件，然后在终端输入ibus restart重启输入法，或者直接删除旧配置，重新设置一遍拼音输入法。

如果上面的方法都不管用，那可能真的是个未修复的bug，你可以去IBus的官方问题反馈渠道提交问题，记得把你的系统版本、输入法版本，还有详细的重现步骤写清楚，开发者应该会跟进处理的。

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Green 绿色