主Git仓库受子目录仓库干扰，执行git status时报错的问题求助

大家好，我最近碰到个Git的棘手问题，想请教下社区的朋友们：

我平时做研究时，习惯把关联的代码仓库克隆到主项目的子目录中，主项目根目录就是我的主Git仓库，所有提交操作都在这个主仓库里完成。但换了新Mac之后，这个主仓库突然没法正常工作了。

我先检查了远程仓库配置，执行命令 git remote -v，得到的结果是正确的远程地址：

origin https://github.com/my_user_id/this_project.git (fetch)
origin https://github.com/my_user_id/this_project.git (push)

接着我确认本地仓库的根路径，执行 git rev-parse --show-toplevel，返回的本地路径也没问题：

~/my_user_id/Documents/my_projects/this_project

可当我执行 git status 查看仓库状态时，却弹出了报错提示：

fatal: '~/my_user_id/Documents/my_projects/this_project/other_subproject/.git' not recognized as a git repository

有没有人遇到过类似的情况？麻烦帮我分析下问题出在哪，该怎么解决，非常感谢！

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Joe