我之前也碰到过这个烦人的问题，给你几个亲测有效的解决办法，按顺序试试：

• 右键直接操作（最基础的第一步）：在侧边栏资源管理器里找到那个顽固的文件夹，右键点击它，选择 "Remove Folder from Workspace"（如果是多文件夹工作区）或者 "Close Folder"（单文件夹模式）。有时候可能是你之前没点对位置，再仔细试试。

• 清理工作区缓存文件：如果重启VSCode后文件夹还在，大概率是工作区缓存没更新：

  1. 完全关闭VSCode（包括后台进程）
  2. 根据你的系统找到工作区存储目录：
     • Windows：%APPDATA%\Code\User\workspaceStorage
     • Mac：~/Library/Application Support/Code/User/workspaceStorage
     • Linux：~/.config/Code/User/workspaceStorage
  3. 删除这个目录下的所有文件夹（放心，重启VSCode会自动重建干净的缓存）
  4. 重新打开VSCode，应该就看不到那个文件夹了

• 重置窗口状态：有时候窗口状态缓存出问题也会导致这种情况：

  1. 打开VSCode，按下 Ctrl+Shift+P（Windows/Linux）或 Cmd+Shift+P（Mac）唤起命令面板
  2. 输入 "Window: Reset Window State" 并执行
  3. VSCode会自动重启，重启后资源管理器的状态会恢复默认

• 排查扩展冲突：少数扩展可能会干扰资源管理器的正常操作：

  1. 按下 Ctrl+Shift+P（Windows/Linux）或 Cmd+Shift+P（Mac），输入 "Extensions: Disable All Installed Extensions" 并执行
  2. 重启VSCode，尝试移除文件夹
  3. 如果能成功移除，再逐个启用扩展，找到导致问题的那个扩展，要么更新它要么卸载掉

内容的提问来源于stack exchange，提问作者anonymous