这个问题其实是Shiny组件的运行机制差异导致的，我来给你拆解清楚：

原因分析 #

• fileInput是客户端组件：它底层依赖浏览器的原生文件选择对话框，所有文件选择操作都是在你本地浏览器里完成的。不管你的Shiny应用跑在Docker容器还是远程服务器上，浏览器只能访问你本地电脑的文件系统，所以点击fileInput会打开你本地的文件选择器——这是它的设计逻辑：用来让用户上传本地文件到服务器（Docker容器），而非直接访问服务器的文件。
• shinyDirButton是服务器端组件：shinyFiles包的组件逻辑完全在Shiny服务器（也就是Docker容器内部）执行。它会遍历容器内的文件系统，把目录结构返回给前端显示，所以你看到的是Docker容器里的文件，所有文件操作都发生在容器内部。

解决方法 #

根据你的需求不同，有两种处理方式：

需求1：访问Docker容器内的文件 #

如果你的目标是让用户选择Docker容器里已有的文件，别用fileInput，改用shinyFiles包配套的shinyFileButton，它和shinyDirButton的运行逻辑一致，能直接访问容器内的文件系统。示例代码如下：

# UI部分
ui <- fluidPage(
  shinyFileButton("select_file", "选择容器内文件", "请选择一个文件", multiple = FALSE)
)

# 服务器部分
server <- function(input, output, session) {
  # 获取容器内的可访问目录（默认是根目录，可自定义）
  available_volumes <- getVolumes()
  # 初始化文件选择器
  shinyFileChoose(input, "select_file", roots = available_volumes, session = session)
  
  # 处理选中的文件
  observeEvent(input$select_file, {
    if (!is.null(input$select_file)) {
      # 获取容器内的文件路径
      file_path <- parseFilePaths(available_volumes, input$select_file)$datapath
      # 后续处理逻辑...
    }
  })
}

需求2：上传本地文件到Docker容器 #

如果你的需求是让用户把本地文件上传到Docker容器里处理，那fileInput的行为是完全正常的。用户选择本地文件后，Shiny会自动把文件上传到容器的临时目录，你可以通过input$file_input_id$datapath获取容器内的文件路径来进行后续分析。示例：

# UI部分
ui <- fluidPage(
  fileInput("upload_file", "上传本地文件")
)

# 服务器部分
server <- function(input, output, session) {
  observeEvent(input$upload_file, {
    if (!is.null(input$upload_file)) {
      # 获取容器内的临时文件路径
      container_file_path <- input$upload_file$datapath
      # 比如读取文件
      data <- read.csv(container_file_path)
      # 后续处理...
    }
  })
}

额外注意事项 #

如果需要shinyFiles访问Docker容器外的目录（比如你本地的某个文件夹），记得在启动Docker容器时通过挂载卷的方式把本地目录映射到容器内，比如：

docker run -v /your/local/folder:/container/target/folder -p 3838:3838 your-shiny-image

这样shinyDirButton/shinyFileButton就能看到/container/target/folder下的内容，也就是你本地/your/local/folder里的文件了。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者kintany