这个问题我之前也踩过坑！核心原因是你在创建子窗口时误用了Tk()而不是Toplevel()。

Tkinter框架的设计规则是：一个应用程序只能有一个主Tk()实例（也就是你主文件里的root = Tk()）。如果强行创建第二个Tk()实例，会导致两个独立的Tk上下文，你的BooleanVar变量会绑定到第二个Tk实例上，但事件处理时无法正确同步状态，所以不管怎么勾选，获取到的永远是初始的False。

修复步骤非常简单： #

只需要修改sub_GUI.py里创建子窗口的代码，把Tk()替换成Toplevel()即可：

修改后的sub_GUI.py完整代码：

from tkinter import *

var1 = None
sub_root = None

def create_widgets():
    global sub_root
    global var1
    var1 = BooleanVar()
    Checkbutton(sub_root, text="A", variable=var1, command=do_something ).grid(row=2, column=0, sticky=W)

def do_something():
    global var1
    is_current_joint_checked = var1.get()
    if is_current_joint_checked:
        print('True')
    else:
        print('False')

def create_new_window():
    global sub_root
    # 替换Tk()为Toplevel()
    sub_root = Toplevel()
    sub_root.title("Movie Chooser")
    create_widgets()

为什么这样改能解决问题？ #

Toplevel()是Tkinter专门用于创建子窗口的组件，它会依附于主窗口的Tk上下文，所有变量（比如BooleanVar）都能正确绑定到对应的控件上，状态变化可以实时同步。而多个Tk()实例会各自维护独立的事件循环和变量管理系统，直接破坏了Tkinter的内部逻辑。

额外优化建议 #

尽量避免使用from tkinter import *，改用import tkinter as tk的方式引用组件，比如tk.Toplevel()、tk.BooleanVar()，这样能避免命名冲突，代码可读性也更强。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者David