AWS EC2实例无法安装data.table R包问题求助

嘿，看了你的错误信息，核心问题其实很明确——你的系统缺少R的开发依赖包，这才是导致编译失败的根源，和你设置的MakeVars文件关系不大。

先看错误里的两个关键提示：

Warning: R include directory is empty -- perhaps need to install R-devel.rpm or similar
fatal error: R.h: No such file or directory

R.h是R开发所需的核心头文件，默认不会随基础R包安装，必须单独安装R-devel包才能获得。

第一步：安装R开发依赖包 #

从你的系统路径x86_64-redhat-linux-gnu来看，你用的是RedHat/CentOS这类基于RPM的系统，直接用包管理器安装即可：

# 对于CentOS/RHEL 7及以下版本
sudo yum install R-devel

# 对于CentOS/RHEL 8+或Fedora系统
sudo dnf install R-devel

第二步：确认MakeVars文件的正确性（可选） #

你提到的MakeVars文件没起作用，大概率是文件名或路径不对：R读取的是小写的Makevars（注意最后是s小写），且必须放在用户主目录的.R文件夹下，也就是正确路径是~/.R/Makevars（对应你的用户就是/home/user1/.R/Makevars）。

如果确实需要指定gcc版本，建议把内容调整为（保证C和C++编译器版本一致）：

CC = /usr/bin/gcc64
CXX = /usr/bin/g++64
SHLIB_OPENMP_CFLAGS = -fopenmp
SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS = -fopenmp

第三步：重新安装data.table #

完成上述步骤后，再回到R里执行安装命令：

install.packages("data.table")

这样应该就能顺利编译安装了。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者ML_Enthousiast