嘿，这个问题我之前也碰到过！直接用两次带--delete的rsync肯定不行——第一次同步第一个磁盘后，第二次用--delete会把备份里属于第一个磁盘但第二个磁盘没有的文件删掉，完全不符合合并的需求。不过我们可以分几步来实现你的目标：既要合并两个源的内容，又要能同步删除（也就是两个源里都不存在的文件，备份里也要删掉）。

核心思路 #

先把两个源的内容都同步到备份目录（不删除任何东西），然后再单独处理“删除两个源都没有的文件”这个需求。具体步骤如下：

1. 先合并两个源的内容到备份目录 #

首先分别同步两个外部磁盘到服务器的备份目录，不要加--delete参数，这样就能把两个磁盘的内容合并到一起：

# 同步第一个磁盘
rsync -av --exclude '.*' /path/to/first/disk/ your-server:/path/to/backup

# 同步第二个磁盘
rsync -av --exclude '.*' /path/to/second/disk/ your-server:/path/to/backup

这一步完成后，备份目录里就会有两个磁盘的所有文件了，比如你例子里的A/1-5和B/10-30都会存在。

2. 处理“同步删除”的需求 #

这一步是关键：我们需要生成一个包含两个源所有文件的列表，然后告诉rsync只保留这个列表里的文件，删掉其他的。

步骤分解：

• 先生成两个源的所有文件的相对路径列表（要和备份目录里的路径对应）：

# 创建临时文件存放文件列表
TMP_LIST="/tmp/backup_files.txt"
rm -f "$TMP_LIST"

# 提取第一个磁盘的文件相对路径，排除隐藏文件
find /path/to/first/disk -type f -not -path '*/\.*' | sed "s|^/path/to/first/disk/||" >> "$TMP_LIST"

# 提取第二个磁盘的文件相对路径，追加到列表
find /path/to/second/disk -type f -not -path '*/\.*' | sed "s|^/path/to/second/disk/||" >> "$TMP_LIST"

# 去重，避免同一个文件被重复列出
sort -u "$TMP_LIST" -o "$TMP_LIST"

• 然后用rsync的--files-from参数指定要保留的文件，再用--delete-excluded删掉不在列表里的文件：

rsync -av --delete-excluded --delete-empty-dirs --files-from="$TMP_LIST" / your-server:/path/to/backup

这里的/是因为我们用的是相对路径，rsync会基于这个根路径去匹配列表里的文件，最终只会保留两个源里存在的文件，同时删掉那些两个源都没有的旧文件；--delete-empty-dirs还会顺便清理掉备份目录里空的文件夹（如果两个源里对应的目录都空了的话）。

整合完整脚本 #

把上面的步骤写成一个可执行脚本，用起来更方便：

#!/bin/bash
# 配置你的路径
SRC1="/path/to/your/first/external/disk"
SRC2="/path/to/your/second/external/disk"
SERVER="your-server-username@your-server-ip"
BACKUP_DIR="/path/to/backup/on/server"

# 第一步：同步两个源到备份目录，合并内容
rsync -av --exclude '.*' "$SRC1"/ "$SERVER:$BACKUP_DIR"
rsync -av --exclude '.*' "$SRC2"/ "$SERVER:$BACKUP_DIR"

# 第二步：生成合并后的文件列表
TMP_FILE="/tmp/combined_backup_files.txt"
rm -f "$TMP_FILE"

# 提取第一个源的文件相对路径
find "$SRC1" -type f -not -path '*/\.*' | sed "s|^$SRC1/||" >> "$TMP_FILE"
# 提取第二个源的文件相对路径
find "$SRC2" -type f -not -path '*/\.*' | sed "s|^$SRC2/||" >> "$TMP_FILE"
# 去重
sort -u "$TMP_FILE" -o "$TMP_FILE"

# 第三步：清理备份目录中两个源都不存在的文件和空目录
rsync -av --delete-excluded --delete-empty-dirs --files-from="$TMP_FILE" / "$SERVER:$BACKUP_DIR"

# 清理临时文件
rm -f "$TMP_FILE"

重要提醒 #

• 测试的时候一定要加--dry-run参数！比如在rsync命令后加--dry-run，这样只会显示要执行的操作，不会真的修改文件，避免误删重要内容。
• 确保你的rsync版本支持这些参数（大部分现代版本都没问题）。
• 如果两个源里有同名文件，后面同步的那个（也就是第二个磁盘的文件）会覆盖第一个的——如果需要区分同名文件，你可能需要额外处理，但根据你的描述，目录结构一致，应该不会有同名文件冲突的问题。

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Jure Merhar