听起来你遇到的问题挺闹心的——GitHub Desktop莫名显示你没执行过的缩进/空格变更，还有Merge branch 'Project' of https://github.com/'user'/'project'…这类奇怪的合并提交，甚至涉及你从未修改过的文件，而团队其他人都没这情况。结合你用Atom编辑器的背景，大概率和本地自动格式化工具或Git配置/合并行为有关，下面一步步帮你排查解决：

1. 先查Atom的自动格式化插件 #

你怀疑自动修正工具是找对方向了！Atom里很多格式化插件会在后台偷偷调整代码格式（比如缩进、空格），哪怕你没手动保存：

• 打开Atom，点顶部菜单的Settings > Packages，搜一下这些常见格式化插件：prettier-atom、atom-beautify、autopep8（Python项目的话）、js-beautify等
• 看看这些插件的设置里，是不是开了**"Format on Save"甚至"Format on Type"**，更夸张的是有些插件会自动检测文件变更就格式化
• 先临时禁用这些插件，然后拉取最新代码，看看还会不会出现莫名的格式变更

2. 检查Git的换行/空格处理配置 #

Git本身有处理换行符和空格的设置，如果你和团队成员的配置不一致，很容易出现这种“伪变更”：

• 打开终端，输入这条命令看当前Git配置：

  git config --list | grep -E "(core.autocrlf|core.safecrlf|core.whitespace)"
  

• 举个例子：Windows系统一般把core.autocrlf设为true，而macOS/Linux常用input，如果你的配置和团队不一样，Git会自动转换换行符，看起来就像空格/缩进变了
• 建议统一团队的Git换行配置，比如Windows用户执行：

  git config --global core.autocrlf true
  

  macOS/Linux用户执行：

  git config --global core.autocrlf input
  

3. 排查GitHub Desktop的自动合并行为 #

你看到的那条合并提交记录，可能是GitHub Desktop自动帮你做了合并：

• 回忆下你拉取远程代码时，GitHub Desktop是不是默认选了**"Merge"，而不是"Rebase"或者"Fetch only"**
• 如果远程有新提交，而你本地刚好有未提交的变更（哪怕是插件自动生成的格式变更），GitHub Desktop就会自动创建合并提交，这就出现了你看到的那条奇怪记录
• 可以去GitHub Desktop的Settings > Git里，把拉取时的默认行为改成**"Rebase and merge"**，或者先手动fetch再处理，避免自动生成不必要的合并提交

4. 重置本地状态，重新同步 #

如果上面的设置都没问题，试试彻底清理本地的异常变更：

• 先把你自己的重要变更备份好（如果有的话），然后在终端执行：

  git checkout .  # 放弃所有本地未提交的变更
  git fetch origin
  git reset --hard origin/Project  # 强制让本地分支和远程完全同步
  

• 之后再打开Atom，观察会不会还自动产生格式变更

5. 检查项目的.editorconfig文件 #

很多团队会用.editorconfig来统一代码格式规范，如果你的Atom没装对应插件，或者插件配置不对，就会和团队规范冲突，导致自动调整：

• 看看项目根目录有没有.editorconfig文件，里面会定义缩进大小、换行符、空格规则这些
• 在Atom里安装editorconfig插件，确保它能读取并应用这个文件的规则，这样就不会和团队的格式要求不一致了

内容的提问来源于stack exchange，提问作者eWagsJr