RMarkdown中使用ggsave保存corrplot报错的解决咨询及其他绘图保存方法询问

嘿，我来帮你看看这个问题～你遇到的Error in x$theme : $ operator is invalid for atomic vectors报错，其实是两个小细节没注意到，咱们一步步来解决：

直接触发报错的核心原因 #

你在ggsave的参数里写了plot = "sauve"，这里犯了个小错误：你把变量名写成了字符串（加了引号），但ggsave需要的是实际的绘图对象变量，而不是字符串形式的变量名。所以首先要把引号去掉，改成plot = sauve。不过这只是第一步，还有个隐藏的兼容问题需要处理：

corrplot与ggsave的兼容问题 #

ggsave本质是为ggplot系列的绘图设计的，而corrplot包生成的是R基础绘图系统的图形，它返回的并不是标准的ggplot对象，所以哪怕你去掉引号，可能还是会有奇怪的问题。这里给你几个可行的解决办法：

方法1：用R基础绘图设备直接保存 #

这是最适配corrplot的方法，通过打开/关闭绘图设备来保存图形：

# 打开svg格式的绘图设备，指定保存路径和文件名
svg("corrplotchene.svg")
# 绘制相关矩阵图
corrplot(chene_cor)
# 关闭设备，完成保存
dev.off()

方法2：用recordPlot()记录图形后适配ggsave #

如果你还是想用ggsave，可以先把corrplot生成的图形记录下来，再传给ggsave：

# 绘制图形并赋值
sauve <- corrplot(chene_cor)
# 记录当前绘图设备中的图形
recorded_plot <- recordPlot()
# 用ggsave保存记录的图形
ggsave(filename = "corrplotchene.svg", plot = recorded_plot)

方法3：改用支持ggplot的相关矩阵绘图工具 #

如果之后经常要和ggsave配合，可以试试ggcorrplot包，它生成的是标准的ggplot对象，能直接和ggsave兼容：

library(ggcorrplot)
# 生成ggplot类型的相关矩阵图
corr_plot <- ggcorrplot(chene_cor)
# 直接用ggsave保存
ggsave("corrplotchene.svg", plot = corr_plot)

RMarkdown中保存绘图的便捷小技巧 #

其实在RMarkdown里，你完全可以不用手动调用保存函数，直接给代码块加参数就能自动保存图形：

```{r, fig.save="corrplotchene.svg", fig.width=8, fig.height=6}
chene_cor <- cor(Chene_num)
corrplot(chene_cor)

编译RMarkdown的时候，这个代码块的图形就会自动保存成你指定的文件名，还能通过`fig.width`和`fig.height`调整图形大小，特别方便。

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Tom Bielakoff