Ubuntu 16.04下Apache Rewrite规则失效问题求助

我在Ubuntu 16.04系统的Apache 2环境中，用了下面的.htaccess配置来让一款PHP路由工具正常工作：

RewriteEngine On
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . index.php [L]

但奇怪的是，本地Windows环境下一切正常，到了Linux服务器上所有定义好的路由都返回404错误，我推测是.htaccess没有被正确解析。

目前我已经做了这些尝试：

• 多次重启Apache服务
• 执行sudo a2enmod rewrite命令启用了rewrite模块
• 在站点配置文件/etc/apache2/sites-available/website.com.conf的虚拟主机段内添加了以下配置：

<Directory "/var/www/website.com/public_html">
    AllowOverride All
</Directory>

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Musa