公式传参引号困境:R语言自定义lmer函数无法接收非字符串公式
问题分析与解决方案
你的第二个函数有两个关键错误导致它无法正常工作,咱们一步步拆解:
错误1:错误处理了rhs参数的表达式捕获
你用quote(rhs)时,只是捕获了符号rhs本身,而不是用户传入的实际表达式(Species + (1 + Petal.Length | Petal.Width))。要捕获传入的真实表达式,得用substitute(rhs),再把它转换成字符串,才能和因变量拼接成完整公式。
错误2:lapply调用lmer的语法错误
第二个函数里的这行代码:
models <- lapply(models, function(x) lmer, data=df, REML=FALSE)
并没有实际调用lmer函数,只是把lmer函数本身当成返回值放进了列表。正确写法是直接把lmer作为lapply的第三个参数(lapply会自动把每个公式传递给它),或者在匿名函数里显式调用lmer(x, data=df, REML=FALSE)。
修正后的函数
下面是修复后的get_pvals_rhs函数,解决了上述问题:
library(lme4) library(lazyeval) get_pvals_rhs <- function(df, cols, rhs) { cols <- substitute(cols) col_pos <- setNames(as.list(seq_along(df)), names(df)) pos <- eval(cols, col_pos) # 捕获传入的rhs表达式并转为字符串 rhs_str <- deparse(substitute(rhs)) formulas <- lapply(pos, function(x) formula(paste(colnames(df[x]), "~", rhs_str))) # 正确调用lmer,传递每个公式 models <- lapply(formulas, lmer, data=df, REML=FALSE) tvals <- lapply(models, function(x) data.frame(coef(summary(x)))[c(2), ]$t.value) pvals <- lapply(tvals, function(x) { 2 * (1 - pnorm(abs(x))) }) return(unlist(pvals)) }
测试验证
现在运行修正后的函数,就能得到和第一个函数完全一致的结果:
fails_fixed <- get_pvals_rhs(iris, Sepal.Length:Sepal.Width, Species + (1 + Petal.Length | Petal.Width)) fails_fixed # 和第一个函数的结果对比验证 works <- get_pvals_qrhs(iris, Sepal.Length:Sepal.Width, "Species + (1 + Petal.Length | Petal.Width)") all.equal(fails_fixed, works) # 会返回TRUE,说明结果一致
额外小技巧:如果想避免字符串拼接的繁琐,可以用reformulate函数直接组合公式,可读性更好,把生成公式的行替换成下面这行即可:
formulas <- lapply(pos, function(x) reformulate(rhs_str, response = colnames(df[x])))
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Jack Twilley
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