我完全理解你现在的抓狂——本来只是想装个libglpk-dev给R的ChIPseeker用，结果陷入了依赖报错、修复失败、想装代理又卡回依赖的死循环，太闹心了！下面给你一步步拆解解决思路：

第一步：先解决依赖修复时的下载失败问题 #

你遇到的Connection reset by peer本质是当前用的kakao镜像源不稳定，导致下载openjdk-11-jdk-headless失败，先换个稳定的国内源来解决这个问题：

1. 先备份当前的源配置，避免改坏了无法恢复：

   sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.bak
   

2. 编辑源列表文件：

   sudo nano /etc/apt/sources.list
   

3. 把文件里的所有内容替换成Ubuntu 22.04（jammy）的国内稳定源（内容如下）：

   deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ jammy main restricted universe multiverse
   deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ jammy-updates main restricted universe multiverse
   deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ jammy-backports main restricted universe multiverse
   deb http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ jammy-security main restricted universe multiverse
   

4. 保存并退出编辑器：按Ctrl+O，回车确认保存，再按Ctrl+X退出。
5. 更新源并重新尝试修复依赖：

   sudo apt update
   sudo apt --fix-broken install
   

   这次应该能顺利下载需要的包了，国内源的稳定性比kakao源好很多，基本不会出现连接重置的问题。

第二步：修复完系统依赖后，再安装Squid代理 #

等apt --fix-broken install执行完成，系统的依赖链就恢复正常了，这时候再安装Squid就不会再遇到之前的依赖报错：

1. 再次更新源确保最新：

   sudo apt update
   

2. 安装Squid：

   sudo apt install squid
   

   此时所有依赖都会被自动拉取并安装，不会再出现未满足依赖的提示。

应急方案：如果换源还是无法下载 #

万一换源后依然遇到下载问题，可以试试手动下载缺失的deb包：

1. 从报错信息里找到需要下载的包的完整名称，比如你遇到的openjdk-11-jdk-headless_11.0.21+9-0ubuntu1~22.04_amd64.deb
2. 用其他稳定网络（比如手机热点）下载这个包到本地电脑
3. 用dpkg命令本地安装：

   sudo dpkg -i /你的下载路径/openjdk-11-jdk-headless_xxx.deb
   

4. 最后再运行apt --fix-broken install完成剩余的依赖配置。

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Jdana