如何用Linux快捷方式计算文件中两列差值并输出指定结果

这事儿交给awk就对了，它天生就是用来处理这类文本列操作的工具，一行命令就能搞定：

awk '{print $1, $3 - $2, $4, $5, $6, $7}' your_input_file > output_file

命令细节解释： #

• awk会逐行读取你的输入文件，自动按空格分割每一行的内容
• $1 保留第一列的scaffold编号内容
• $3 - $2 自动计算第3列与第2列的数值差，用这个差值替换掉原来的两列
• $4到$7 直接保留原文件中第4到第7列的所有内容
• 最后通过>把结果输出到新的output_file里，不会修改原文件，更安全

如果需要直接覆盖原文件（记得先备份！）： #

如果你不想生成新文件，想直接修改原文件，可以借助sponge工具（需要先安装moreutils包，比如Debian/Ubuntu用apt install moreutils，RHEL/CentOS用yum install moreutils）：

awk '{print $1, $3 - $2, $4, $5, $6, $7}' your_input_file | sponge your_input_file

要是没有sponge，也可以用临时文件中转的方式：

awk '{print $1, $3 - $2, $4, $5, $6, $7}' your_input_file > temp_file && mv temp_file your_input_file

用这个命令处理你给出的示例内容，完全能得到你想要的输出格式，不管文件多长都能高效处理～

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Alex Trevylan