Mac OS下Anaconda环境中使用Swig触发PyThreadState_Get错误求助

我之前也碰到过一模一样的问题，这个致命错误本质是Anaconda环境的Python和Mac系统自带Python的链接冲突导致的——Swig编译的时候可能不小心用了系统的Python库，运行时却调用Anaconda的Python，直接搞崩了线程状态。下面是亲测有效的解决步骤：

1. 把编译环境绑定到Anaconda #

首先激活你的目标Anaconda环境，然后强制让编译器优先用Anaconda里的Python头文件和库，别去碰系统的：

conda activate 你的环境名
export CFLAGS="-I$CONDA_PREFIX/include/python3.6m $CFLAGS"
export LDFLAGS="-L$CONDA_PREFIX/lib -lpython3.6m $LDFLAGS"

注意把python3.6m换成你环境里实际的Python版本（比如3.8的话就是python3.8），可以用python --version确认。

2. 修正Swig编译配置 #

如果你的项目用了Makefile，一定要把里面的Python路径全改成Anaconda环境的：

• 把PYTHON_INCLUDE改成$(CONDA_PREFIX)/include/pythonX.Xm
• 把PYTHON_LIB改成$(CONDA_PREFIX)/lib

另外，在你的Swig接口文件（.i文件）开头加一段代码，确保运行时优先用当前环境的Python：

%module 你的模块名
%pythonbegin %{
import sys
sys.path.insert(0, '.')
%}

3. 彻底重新编译 #

把之前编译生成的.dylib（Mac下的动态库文件）或者.so文件删掉，然后重新编译：

make clean
make

4. 确认运行环境 #

编译完之后，一定要在激活的Anaconda环境里运行脚本，别搞错成系统Python了。可以用which python检查一下，输出的路径应该是你Anaconda环境下的Python。

这个问题的核心就是让Swig从编译到运行全链路都绑定Anaconda的Python，彻底和系统Python划清界限，这样线程状态就不会混乱了。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者pkuhar