R 3.5.x与Dropbox同步时RStudio编译报错问题求助

我之前也碰到过一模一样的问题！升级R到3.5.x版本后，在Dropbox同步的项目里用RStudio编译pandoc或pdflatex时，总是弹出文件无法打开的错误，连带着图片生成的警告，折腾了好久才搞定，给你分享几个亲测有效的解决办法：

• 先确认Dropbox同步状态
  Dropbox在同步文件时会给文件加临时锁，而RStudio编译文档时需要频繁读写中间文件（比如你看到的reportDucret_files/figure-docx/ipss1-1.png这类图片），两者冲突就会导致无法打开连接。编译前先等Dropbox完全同步完，或者暂时暂停Dropbox同步，编译完成后再恢复同步就行。

• 修改knitr的临时文件输出路径
  R 3.5.x对文件权限的管控更严格，Dropbox同步目录的权限有时候会限制R的读写操作。你可以把图片等临时文件的输出路径改成本地非同步目录：
  要么在RStudio里手动设置：Tools -> Global Options -> Sweave，把「Output directory」改成本地的独立文件夹（比如~/R_temp_output）；
  要么在你的Rmd脚本开头加这段代码：

  knitr::opts_chunk$set(fig.path = "~/R_temp_output/figure-")
  

  这样生成的图片就不会存在Dropbox同步目录里，从根源上避免同步冲突。

• 更新knitr和rmarkdown包
  旧版本的knitr可能和R 3.5.x存在兼容性问题，打开R控制台运行下面的命令更新这两个核心包：

  update.packages(c("knitr", "rmarkdown"))
  

  很多时候这类版本兼容问题，更新包就能直接解决。

• 检查项目路径和文件名
  如果你的项目路径或者文件名里有空格、特殊字符（比如中文、重音符号），R 3.5.x的文件处理模块可能会识别出错。尽量把项目移到路径简单的目录下，比如~/Dropbox/R_Projects/MyReport，避开复杂路径。

错误原因补充 #

R 3.5.x版本对文件IO的安全性做了升级，对文件锁的检测更敏感。而Dropbox在同步时会占用文件资源，导致R无法正常打开或写入编译过程中生成的临时文件（比如图片、中间文档），这就是你看到Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : can't open this connection和图片警告的核心原因。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Giorgio Spedicato