使用cs_freeze打包Python为exe后遇scipy.spatial.ckdtree模块未找到错误

嘿，这个问题我熟！很多人用cx_Freeze打包带scipy的Python程序时都会踩这个坑，核心原因就是cx_Freeze默认没法自动识别scipy这类库的二进制扩展文件——你看到的ckdtree.cp36-win32.pyd其实就是Windows平台下的Python扩展模块（相当于Linux里的.so文件），但cx_Freeze没把它自动包含进打包后的程序里。

给你几个亲测有效的解决办法：

方法1：在setup.py里明确指定要包含的模块 #

直接修改你的cx_Freeze打包脚本setup.py，在build_exe选项里添加includes参数，把scipy.spatial.ckdtree和scipy本身都列进去，让cx_Freeze主动去找这个模块。示例代码如下：

from cx_Freeze import setup, Executable

# 替换成你的主程序文件名
target = Executable(script="your_main_script.py")

setup(
    name="你的程序名",
    version="1.0",
    description="程序描述",
    executables=[target],
    options={
        "build_exe": {
            "includes": ["scipy.spatial.ckdtree", "scipy"],
            # 要是后面还缺其他scipy模块，直接往这里加就行
        }
    }
)

改完后重新运行python setup.py build打包，这次cx_Freeze就会把ckdtree的.pyd文件一起打包进去了。

方法2：手动复制.pyd文件到exe目录 #

如果方法1没搞定，那就来个简单粗暴的：找到你Python安装目录下Lib\site-packages\scipy\spatial里的ckdtree.cp36-win32.pyd文件，手动复制到打包后生成的exe所在的build\exe.win32-3.6\Lib\scipy\spatial目录里（路径根据你的Python版本和打包输出位置调整），复制完再运行exe试试，大概率就能正常跑了。

方法3：用include_files参数自动复制文件 #

要是不想手动复制，也可以在setup.py里用include_files参数直接指定要打包的.pyd文件路径，这样打包时会自动把它复制到对应目录。示例代码：

import os
import scipy

# 其他参数不变
setup(
    # ... 这里填你的name、version等信息
    executables=[target],
    options={
        "build_exe": {
            "include_files": [
                os.path.join(os.path.dirname(scipy.__file__), "spatial", "ckdtree.cp36-win32.pyd")
            ]
        }
    }
)

另外提个小注意点：你用的是Python3.6，对应的cx_Freeze版本最好选5.x系列，因为高版本的cx_Freeze已经不再支持Python3.6了，版本不兼容也可能导致这类模块找不到的问题哦。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Abin John Thomas