嗨，作为Python爱好者遇到这个问题很正常，我来帮你理清楚原因和解决办法～

你遇到的问题核心在于图像格式的压缩特性和图像颜色模式这两个点，咱们一步步来解决：

为什么修改后的像素值保存后变了？ #

1. JPEG是有损压缩格式：你保存用的tree-ALT.jpg是JPEG格式，这种格式为了缩小文件大小，会对图像数据进行有损压缩，哪怕你只改了一个像素，保存时也会被压缩算法调整，导致像素值和你设置的不一样。
2. 图像可能是索引颜色模式：如果你的原图是P模式（索引颜色），这种模式的图像是用调色板存储颜色的，你调用putpixel时，PIL会自动把你设置的RGB值映射到调色板里最接近的颜色，自然就和你设置的不一样了。

解决办法 #

步骤1：确保图像是RGB模式

打开图像时先转换成RGB模式，避免索引模式的影响：

from PIL import Image
# 打开图像并强制转换为RGB模式
img = Image.open('tree.jpg').convert('RGB')

步骤2：用无损格式保存

想要精确保留像素值，一定要用无损压缩的图像格式，比如PNG：

# 修改[5,5]像素为(0,0,118)
img.putpixel((5,5), (0,0,118))
# 保存为PNG格式
img.save('tree-ALT.png')

步骤3：验证修改结果

现在再读取保存后的图像，就能看到正确的像素值了：

# 读取修改后的图像
img_verify = Image.open('tree-ALT.png')
# 获取[5,5]像素值
print(img_verify.getpixel((5,5)))  # 输出应该是(0,0,118)

额外小提示 #

如果你因为某些原因必须保存为JPEG，可以尝试设置最高质量参数，虽然不能完全避免损失，但能尽量接近你设置的值：

img.save('tree-ALT.jpg', quality=100)

不过还是更推荐用PNG来保证像素值的绝对准确哦～

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Markas M