在R Notebook中设置knitr语法高亮主题无效，求正确配置方法？

嘿，我来帮你搞定这个knitr高亮主题不生效的问题！你的核心问题在于R Notebook（包括预览和编织后的HTML）默认用的是highlight.js处理代码高亮，而不是knitr的内置高亮系统，所以你用knit_theme$set()的方法根本起不到作用。下面分两种场景给你正确的设置方式：

一、针对HTML Notebook（预览+编织后） #

直接在YAML配置里指定highlight.js对应的主题即可，不需要写那一段knitr的代码。具体修改如下：

output:
  html_notebook:
    code_folding: none
    df_print: kable
    theme: yeti
    toc: yes
    toc_depth: 4
    highlight: molokai  # 新增这一行，指定highlight.js的molokai主题

保存后重新预览或编织Notebook，代码高亮就会变成molokai样式了。

二、针对普通HTML Document（如果需要输出成独立HTML） #

如果你是要编织成普通的html_document，有两种可选方案：

方案1：用highlight.js主题（推荐，和Notebook风格一致） #

同样在YAML里直接指定主题：

output:
  html_document:
    df_print: kable
    highlight: molokai

方案2：用knitr内置高亮（适合需要完全自定义knitr样式的场景） #

先在YAML里设置使用knitr的高亮系统，再用代码加载主题：

output:
  html_document:
    df_print: kable
    highlight: knitr  # 指定用knitr的高亮系统

然后在R代码块里加载并设置主题：

library(knitr)
thm = knit_theme$get("molokai")
knit_theme$set(thm)

补充说明：为什么原来的方法没用？ #

knit_theme是控制knitr原生的代码高亮渲染，这种方式主要用于LaTeX输出，或者是明确指定了highlight: knitr的HTML输出。而R Notebook默认依赖highlight.js来动态渲染代码高亮，所以knit_theme$set()对它完全无效，必须通过YAML里的highlight参数指定highlight.js的主题才行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Carmen Sandoval