ggplot2设置alpha后图形仍不透明？叠加数据框代码问题求助

嗨，我来帮你搞定这个透明度不生效的小问题～

问题根源 #

你把alpha = 0.05放在了aes()函数内部，这是关键错误！在ggplot2里，aes()是用来映射数据变量到图形属性的，当你把固定值0.05放进aes()时，ggplot会把它当成一个分类变量，然后使用默认的透明度比例尺，最终呈现的透明度完全不是你想要的0.05。

解决方案 #

把alpha = 0.05从aes()里移出来，直接作为geom_point()的参数即可——这样就是给这批点设置固定的透明度了。

修改后的完整代码如下：

plot3 <- ggplot(fit3f, aes(x=exp(exp(.fitted)), y=.resid)) + 
  ggtitle("data points: 3") + 
  xlab("Amplification") + 
  ylab("res. pear.") + 
  geom_point(colour="dodgerblue4") + 
  # ylim(c(0,1)) + 
  geom_vline(xintercept=150, linetype="dashed", colour="orange", size=2) + 
  geom_point(data=fit3f_not_irr, aes(exp(exp(.fitted)), y=.resid, colour="firebrick4"), 
             alpha = 0.05, show.legend = FALSE)

额外小提示 #

如果你的透明度需要根据数据中的某个变量动态变化（比如根据某列数值调整透明度），这时候才需要把alpha放进aes()里，比如aes(alpha = your_variable)，ggplot会自动为不同的变量值分配对应的透明度。但固定值的话，一定要放在aes()外面哦！

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ben