Mariadb休眠1.001秒触发「MySQL server has gone away」，求定位1秒超时配置位置

各位好，我最近调试MariaDB连接时碰到了个特别精准的奇怪问题：

当我运行这段代码时，一切正常：

$db = new mysqli(...);
usleep(1000*1000); // 休眠1秒完全没问题
$db->query('SELECT 1');

可只要把休眠时间改成1.001秒，立刻就会抛出「MySQL server has gone away」的错误：

$db = new mysqli(...);
usleep(1001*1000); // 就多了0.001秒连接就断了
$db->query('SELECT 1');

我肯定这是某个配置里的1秒超时限制在搞鬼，但把常见的超时配置翻了个遍还是没找到对应的项，现在完全没思路了，有没有大佬能帮我定位下这个1秒超时到底是哪个配置控制的？

备注：内容来源于stack exchange，提问作者rooobertek