保存/读取numpy ndarray至文本文件时行数减少1行的问题

咱们来捋下行数减少的问题，主要踩了这几个坑：

• 误跳过第一行数据：你用f.readline()想跳过“表头”，但实际上np.savetxt保存这个数组时根本没写表头，这直接把第一行数据给跳过了，总行数自然少了1——这是最直接的原因。
• 数据类型不匹配（隐藏风险）：你保存的是字符串类型数组（字典键大多是字符串，而且指定了fmt='%s'），但读取时np.loadtxt()默认会按浮点数解析。如果你的键不是纯数字字符串，轻则读取报错，重则可能导致部分行被异常忽略，间接影响行数统计。
• 文件路径不一致：保存的路径是'filepath/file.txt'，读取的却是"step_2/Part_DBS/S3_DBs/GO_For_SVM.txt"——如果这俩不是同一个文件，那你读的本来就是行数更少的文件，也会出现这个问题。
• 变量名踩坑：你用了dict当变量名，这会覆盖Python内置的dict类，后续再想创建字典就会出问题，这是个容易忽略的隐藏bug。

针对这些问题，给你调整好的代码：

#!/usr/bin/env python
import numpy as np

# 重点：别用dict当变量名，换成my_dict这类自定义名字
my_dict = {"apple": 1, "banana": 2, "cherry": 3}  # 示例字典，替换成你的实际字典
dictkey = my_dict.keys()
Xarr = np.array(dictkey).reshape(-1, 1)
print("保存前数组形状:", Xarr.shape)

# 统一文件路径，避免路径不一致的问题
file_path = "step_2/Part_DBS/S3_DBs/GO_For_SVM.txt"
np.savetxt(file_path, Xarr, fmt='%s')

# 读取时不要跳过行，并且指定dtype=str读取字符串类型
X = np.loadtxt(file_path, dtype=str)
# 重新reshape保持(R,1)的形状
X = X.reshape(-1, 1)
print("读取后数组形状:", X.shape)

如果后续你需要给文件加表头（比如和其他工具兼容），可以这么写：

# 保存时添加表头
np.savetxt(file_path, Xarr, fmt='%s', header='dict_keys')
# 读取时用skiprows=1跳过表头行
X = np.loadtxt(file_path, dtype=str, skiprows=1).reshape(-1,1)

这样就能保证保存和读取的行数完全一致啦。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Julia