脚本中执行p3-genome-fasta命令报错，但终端直接输入相同命令却正常的问题求助

大家好，我写了个脚本用来根据一些基因组ID获取对应的序列，结果遇到了个挺奇怪的问题——脚本里执行命令时会报错，但把脚本打印出来的命令直接复制到终端里运行却完全正常，实在摸不着头脑，想请各位帮忙分析下原因。

先贴一下我的脚本代码：

# Process each genome ID in array
for id in "${genome_ids[@]}"; do
    echo "Processing genome ID: $id"
    # Construct the command
    command="p3-genome-fasta --protein $id"
    
    # Execute the command
    $command 
done

运行脚本后得到的示例输出是这样的：

Processing genome ID: 1000289.10
p3-genome-fasta --protein 1000289.10
. at /usr/share/bvbrc-cli/deployment/plbin/p3-genome-fasta.pl line 47.

报错提示指向了p3-genome-fasta.pl的第47行，但我把上面输出里的命令p3-genome-fasta --protein 1000289.10直接粘到终端里执行，却能正常工作，完全不会报错。

另外我还找到了p3-genome-fasta.pl里相关的代码片段，是用来处理基因组ID的：

# Get the genome ID.
my ($genomeID) = @ARGV;
if (! $genomeID) {
    die "No genome ID specified.";
} elsif (! ($genomeID =~ /^\d+\.\d+$/)) {
    die "Invalid genome ID $genomeID.";
}

有没有大佬能帮我看看这到底是哪里出问题了？

备注：内容来源于stack exchange，提问作者Alex Lee