在macOS的Python 2.7环境中安装rpy2遇错求助

我来帮你搞定这个安装难题，你遇到的两个错误都是这个环境下的典型问题，咱们一步步来解决：

先搞定clang: error: unsupported option '-fopenmp' #

macOS自带的Clang编译器不支持OpenMP，这就是你装rpy2-2.7.0时报错的核心原因。有两个办法解决：

办法1：用Homebrew装支持OpenMP的GCC #

1. 要是还没装Homebrew，先装一个：

   /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"
   

2. 安装gcc@7（这个版本和rpy2-2.7.0适配性最好）：

   brew install gcc@7
   

3. 临时指定用GCC来编译安装：

   CC=gcc-7 CXX=g++-7 sudo pip install rpy2-2.7.0.tar.gz
   

办法2：直接修改rpy2配置，禁用OpenMP #

不想装GCC的话，直接改rpy2的编译参数就行：

1. 先解压你下载的安装包：

   tar -xzf rpy2-2.7.0.tar.gz
   cd rpy2-2.7.0
   

2. 打开setup.py文件，搜索包含-fopenmp的行——一般在extra_compile_args和extra_link_args这两个参数里，把'-fopenmp'删掉就行。
3. 然后执行本地安装：

   sudo python setup.py install
   

再解决Command "python setup.py egg_info" failed的问题 #

这个错误是因为现在新版的rpy2已经彻底放弃支持Python2.7了，你直接pip install rpy2会拉取不兼容的新版本，所以你选rpy2-2.7.0是完全正确的——这是最后几个支持Python2.7的rpy2版本之一，只要解决上面的编译问题，就能顺利装上。

额外提醒 #

• 确保你的R已经装好，而且Python能找到它。可以先检查R_HOME环境变量：

  echo $R_HOME
  

  如果是空的，临时设置一下（假设你的R装在默认路径）：

  export R_HOME=/Library/Frameworks/R.framework/Resources
  

  再跑安装命令。
• 尽量别用sudo装，权限不够的话，用pip install --user rpy2-2.7.0.tar.gz安装到用户目录，能避免不少权限问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Yves