使用RcppArmadillo构建R包时出现文件名警告问题

这个警告其实很好理解——你把C++代码文件错放到了R代码的参数里啦！

问题原因 #

RcppArmadillo.package.skeleton()的code_files参数是专门用来指定要复制到包的R/目录下的R脚本文件的，而.cpp后缀的文件是C++代码，本该放在包的src/目录下。函数检测到你把cpp文件加到了这个参数里，就会提示你这个文件名在R目录里是无效的。

解决步骤 #

• 修正函数调用，移除cpp文件参数
  把accumulate.cpp从code_files里删掉，只保留R脚本：

  RcppArmadillo.package.skeleton(name = "HACSim", 
                                 code_files = c("HAC.sim.R", "HAC.simrep.R"),
                                 example_code = FALSE)
  

• 手动移动cpp文件到src目录
  生成包骨架后，把你的accumulate.cpp复制到新创建的HACSim/src/文件夹里。如果src目录不存在（一般函数会自动生成，不过保险起见），可以先创建它：

  dir.create("HACSim/src", recursive = TRUE)
  file.copy("accumulate.cpp", "HACSim/src/")
  

• 检查依赖配置（可选但推荐）
  确认包的DESCRIPTION文件里已经包含了必要的依赖项：

  LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo
  Imports: Rcpp
  

  通常RcppArmadillo.package.skeleton()会自动帮你加上这些，但还是可以打开文件核对一下，避免后续编译出错。

这样处理后，再重新运行包的构建流程，那个警告就会消失啦。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者compbiostats