各位大佬好，我最近在处理一组交错采集的T2加权MR图像，为了消除旋转、平移这类几何畸变，分别用FSL和ANTs做了序列切片间的配准。之后我想用SimpleITK的CompositeTransform构建一个复合变换，来完成整体的图像校正。

我仔细检查过生成的复合变换，逻辑上应该是没问题的，但不管用FSL还是ANTs的配准结果，重采样后的图像在最后几个切片（或者切片的部分区域）都会出现灰色伪影。而且这个问题和我往复合变换里加的变换数量无关——不管只加1个，还是加40个，甚至我按「单位矩阵→第1、2个切片的变换矩阵→依次加入所有切片的变换矩阵」的顺序组合，伪影依然存在。

我试过用SimpleITK的SetUseNearestNeighborExtrapolator()方法，这确实能消除伪影，但带来了新问题：当移动图像的像素超出网格范围时，只会把参考图像的像素映射到配准后的图像上，这不符合我的需求。

我已经尝试了各种复合变换的组合方式，实在想不到其他办法了，有没有大佬能给我一些思路或者解决方案？

备注：内容来源于stack exchange，提问作者marlene schichl